ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9843669 | Lung cancer
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

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◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

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◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◢ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

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◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

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◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

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◢ SRX2039599: Liver

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◢ SRX206483: Liver

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◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◣ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Nr4a1 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Etnk2 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Osbpl9 ↻ ≫
Gabarapl2 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Cxcl10 ↻ ≫
Per3 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Ccnt1 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Fosb ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Abhd18 ↻ ≫
Ifi204 ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Zfp623 ↻ ≫
Rela ↻ ≫
1110002E22Rik ↻ ≫
Rin1 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
Glt8d2 ↻ ≫
Chrac1 ↻ ≫
Otud1 ↻ ≫
Pold3 ↻ ≫
Hdac5 ↻ ≫
Krtap1-5 ↻ ≫
Atf3 ↻ ≫
Faf1 ↻ ≫
Spen ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Zbtb10 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Echdc3 ↻ ≫
Nfkbia ↻ ≫
Gm3776 ↻ ≫
Kiz ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Rhebl1 ↻ ≫
Pip4p2 ↻ ≫
Rab8a ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Tmem65 ↻ ≫
Gsta2 ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Mrpl45 ↻ ≫
1190007I07Rik ↻ ≫
Herpud2 ↻ ≫
Srebf2 ↻ ≫
Sprr1a ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Mfsd13a ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Tomt ↻ ≫
Lamtor1 ↻ ≫
Emp1 ↻ ≫
Tob1 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Slc25a35 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Ifnar1 ↻ ≫
Pum1 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Map9 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Mphosph9 ↻ ≫
2810006K23Rik ↻ ≫
Rab3gap2 ↻ ≫
Zfp433 ↻ ≫
Gm32687 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Atg16l2 ↻ ≫
Dguok ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
Fam71e1 ↻ ≫
Emc10 ↻ ≫
Smpdl3b ↻ ≫
Tigit ↻ ≫
5031439G07Rik ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Nolc1 ↻ ≫
Nsun4 ↻ ≫
Cars ↻ ≫
Oser1 ↻ ≫
Hyal1 ↻ ≫
Fbxo31 ↻ ≫
Zfp628 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Coa3 ↻ ≫
Cntd1 ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Lmbr1l ↻ ≫
D2hgdh ↻ ≫
Krtap2-4 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Il23a ↻ ≫
Avpi1 ↻ ≫
Phlda1 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Rras ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Tns1 ↻ ≫
Rufy4 ↻ ≫
Ankrd1 ↻ ≫
Opa3 ↻ ≫
Rnf39 ↻ ≫
Chmp5 ↻ ≫
Bag1 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Zfp653 ↻ ≫
Tmed1 ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Mroh1 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Slc25a32 ↻ ≫
Dcaf13 ↻ ≫
Nudt9 ↻ ≫
Ube2n ↻ ≫
Rnf38 ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Tmem147 ↻ ≫
Polr3h ↻ ≫
Wdyhv1 ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Gtf2e2 ↻ ≫
Xpnpep3 ↻ ≫
St13 ↻ ≫
Thumpd3 ↻ ≫
Arrb2 ↻ ≫
Ptprn ↻ ≫
Taf13 ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Tomm20 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Tmem129 ↻ ≫
Tacc3 ↻ ≫
Pus7l ↻ ≫
Irak4 ↻ ≫
Pinlyp ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Rer1 ↻ ≫
Morn1 ↻ ≫
Csde1 ↻ ≫
Seh1l ↻ ≫
Scaf11 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Limk1 ↻ ≫
Bcl6 ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Rnpc3 ↻ ≫
Tmie ↻ ≫
Als2cl ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Plekhf2 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Gpbp1 ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Mcrs1 ↻ ≫
Rom1 ↻ ≫
Eml3 ↻ ≫
Zfp318 ↻ ≫
Slc35a4 ↻ ≫
Apbb3 ↻ ≫
Slc52a2 ↻ ≫
Fbxl6 ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Fam50b ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Smarcd1 ↻ ≫
Ticam1 ↻ ≫
Gtf2f1 ↻ ≫
Psmd8 ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Agtpbp1 ↻ ≫
Orc4 ↻ ≫
Mbd5 ↻ ≫
Ociad1 ↻ ≫
Fam107b ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
B3gnt3 ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Eif4e ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Sfxn2 ↻ ≫
Arl3 ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Nip7 ↻ ≫
Cog8 ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Ccpg1os ↻ ≫
Ccpg1 ↻ ≫
Sgf29 ↻ ≫
Ovol1 ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Rab5a ↻ ≫
Fam53a ↻ ≫
Cxcl1 ↻ ≫
Ahnak ↻ ≫
Hspbp1 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Ablim1 ↻ ≫
Rbx1 ↻ ≫
Ttc21a ↻ ≫
Gorasp1 ↻ ≫
Thnsl1 ↻ ≫
Enkur ↻ ≫
Cln3 ↻ ≫
Man1b1 ↻ ≫
Zer1 ↻ ≫
Zfat ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Cald1 ↻ ≫
Qars ↻ ≫
Ubxn4 ↻ ≫
Apobr ↻ ≫
Tnks2 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Pkn2 ↻ ≫
Josd1 ↻ ≫
Serinc3 ↻ ≫
Dstn ↻ ≫
Mndal ↻ ≫
Pan2 ↻ ≫
Lactb2 ↻ ≫
Erc1 ↻ ≫
Dhx34 ↻ ≫
Pgm2l1 ↻ ≫
Flot1 ↻ ≫
Tmem198 ↻ ≫
Chpf ↻ ≫
Zfp7 ↻ ≫
Pkib ↻ ≫
Osbpl8 ↻ ≫
Dyrk1b ↻ ≫
Btg1 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Derl1 ↻ ≫
Med21 ↻ ≫
Smurf2 ↻ ≫
Ube2b ↻ ≫
Tmub2 ↻ ≫
Fxr2 ↻ ≫
Eif4b ↻ ≫
Agps ↻ ≫
Gm14137 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Cacul1 ↻ ≫
Timm13 ↻ ≫
Eif3d ↻ ≫
Atp2b1 ↻ ≫
Fbxo3 ↻ ≫
4931422A03Rik ↻ ≫
Mknk2 ↻ ≫
Cfl2 ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Tmco4 ↻ ≫
B3gat3 ↻ ≫
Metap1 ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Pop7 ↻ ≫
Pgap2 ↻ ≫
9130023H24Rik ↻ ≫
Armc5 ↻ ≫
Nup98 ↻ ≫
Atxn7l2 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Bbs5 ↻ ≫
Rps6ka5 ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Mtmr4 ↻ ≫
Chchd5 ↻ ≫
Snx15 ↻ ≫
Rabl2 ↻ ≫
Wrnip1 ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Tjp2 ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Aldoa ↻ ≫
Anapc15 ↻ ≫
Akr1c13 ↻ ≫
Fchsd1 ↻ ≫
Rad18 ↻ ≫
Rnft1 ↻ ≫
Prcc ↻ ≫
Mesd ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Tom1l2 ↻ ≫
Drc3 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Camta1 ↻ ≫
Strn ↻ ≫
Mrps28 ↻ ≫
Ttc16 ↻ ≫
Ptrh1 ↻ ≫
Lrtm2 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Csnk1g2 ↻ ≫
Elf3 ↻ ≫
Rnf115 ↻ ≫
Polr3c ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Zfp706 ↻ ≫
Odaph ↻ ≫
Ap5z1 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Oplah ↻ ≫
Hspe1 ↻ ≫
Hspd1 ↻ ≫
Sgk2 ↻ ≫
Prr13 ↻ ≫
Six5 ↻ ≫
Sgk3 ↻ ≫
Zfp511 ↻ ≫
Tubgcp2 ↻ ≫
Csgalnact2 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Tmem229b ↻ ≫
Cct8 ↻ ≫
Zfp438 ↻ ≫
Tmem175 ↻ ≫
Gak ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Ppp1r16a ↻ ≫
Pam16 ↻ ≫
Zfp384 ↻ ≫
Acadsb ↻ ≫
Ikzf5 ↻ ≫
Cyth1 ↻ ≫
Dbnl ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Tbc1d10c ↻ ≫
Ccdc28a ↻ ≫
Paqr3 ↻ ≫
Supt4a ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
Atg5 ↻ ≫
Nup107 ↻ ≫
Mbtps1 ↻ ≫
G2e3 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Inpp5k ↻ ≫
Ndel1 ↻ ≫
1810037I17Rik ↻ ≫
Gxylt1 ↻ ≫
Mad1l1 ↻ ≫
Ptpn14 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Atf2 ↻ ≫
Ptp4a1 ↻ ≫
Edem1 ↻ ≫
Gm4861 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Ywhab ↻ ≫
Smu1 ↻ ≫
Ahsa2 ↻ ≫
Noxo1 ↻ ≫
Gfer ↻ ≫
Rad23b ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Eloc ↻ ≫
Atg14 ↻ ≫
Unkl ↻ ≫
Dclk1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Sart1 ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Spring1 ↻ ≫
Rnft2 ↻ ≫
Gga1 ↻ ≫
Dyrk1a ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Echs1 ↻ ≫
Itgb1 ↻ ≫
Prpf38a ↻ ≫
Orc1 ↻ ≫
Taf5 ↻ ≫
Prr12 ↻ ≫
Spg7 ↻ ≫
Tmco6 ↻ ≫
Tram2 ↻ ≫
Lsm1 ↻ ≫
Bag4 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Ccm2 ↻ ≫
Rmc1 ↻ ≫
Nup93 ↻ ≫
Usp32 ↻ ≫
Shmt1 ↻ ≫
Calr3 ↻ ≫
Hdlbp ↻ ≫
Ppp1cb ↻ ≫
Septin2 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Sertad2 ↻ ≫
Tomm40 ↻ ≫
Fam76a ↻ ≫
Odc1 ↻ ≫
Nckap5l ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
H2-K1 ↻ ≫
Ints1 ↻ ≫
Tank ↻ ≫
Phykpl ↻ ≫
Tmem123 ↻ ≫
Topors ↻ ≫
Smim27 ↻ ≫
Mpp4 ↻ ≫
Rhbdl2 ↻ ≫
Esyt2 ↻ ≫
Nfat5 ↻ ≫
Ppp4c ↻ ≫
Ncaph2 ↻ ≫
Lmf2 ↻ ≫
Dph5 ↻ ≫
Eif3a ↻ ≫
Papss1 ↻ ≫
Mgat1 ↻ ≫
Rtn3 ↻ ≫
Ubfd1 ↻ ≫
Ears2 ↻ ≫
Otud7b ↻ ≫
Gcnt2 ↻ ≫
Smg9 ↻ ≫
Ankrd13c ↻ ≫
Nxf1 ↻ ≫
Osbpl2 ↻ ≫
Pip4k2c ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Spg11 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Nelfb ↻ ≫
Cant1 ↻ ≫
Naa40 ↻ ≫
Atf7 ↻ ≫
Pip5kl1 ↻ ≫
Coq8b ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Ippk ↻ ≫
Myl12a ↻ ≫
Vps26c ↻ ≫
Capn10 ↻ ≫
Cuta ↻ ≫
Vkorc1 ↻ ≫
Cnot11 ↻ ≫
Ufsp1 ↻ ≫
Mib2 ↻ ≫
Dnal4 ↻ ≫
Alad ↻ ≫
Meaf6 ↻ ≫
Ankrd55 ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Ndrg1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Plekhn1 ↻ ≫
Zfp619 ↻ ≫
Tst ↻ ≫
Mpst ↻ ≫
Rbfox2 ↻ ≫
Mob2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Acaa1a ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
Mcur1 ↻ ≫
Arih1 ↻ ≫
Ccnt2 ↻ ≫
Cic ↻ ≫
Syf2 ↻ ≫
Napepld ↻ ≫
Atp1b3 ↻ ≫
Bcas3 ↻ ≫
Rfx3 ↻ ≫
Trpm4 ↻ ≫
Dsn1 ↻ ≫
Foxa1 ↻ ≫
Inpp5e ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Inpp4a ↻ ≫
Map3k2 ↻ ≫
Cbx5 ↻ ≫
Creld2 ↻ ≫
Alg12 ↻ ≫
Usp48 ↻ ≫
Sptan1 ↻ ≫
Tgoln2 ↻ ≫
Tgoln1 ↻ ≫
Aip ↻ ≫
Usp53 ↻ ≫
Tmem134 ↻ ≫
Cdkn2b ↻ ≫
Sdcbp2 ↻ ≫
Kxd1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Skp1 ↻ ≫
Nudt8 ↻ ≫
Klhl9 ↻ ≫
Ralgapa1 ↻ ≫
Inpp5a ↻ ≫
Kdm2a ↻ ≫
Tjap1 ↻ ≫
Zbed4 ↻ ≫
Klf9 ↻ ≫
Troap ↻ ≫
Zfyve27 ↻ ≫
Zfp319 ↻ ≫
Usb1 ↻ ≫
Cd151 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Gclm ↻ ≫
Bnip3l ↻ ≫
Fbxw7 ↻ ≫
Tmc6 ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Rfc4 ↻ ≫
Tmc8 ↻ ≫
Smchd1 ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Zfp276 ↻ ≫
Vps9d1 ↻ ≫
Rnf170 ↻ ≫
Hook3 ↻ ≫
Pik3ca ↻ ≫
Urm1 ↻ ≫
Lrp1 ↻ ≫
Casc3 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Rhot2 ↻ ≫
Get4 ↻ ≫
Ahi1 ↻ ≫
Txn2 ↻ ≫
Arfip1 ↻ ≫
9130401M01Rik ↻ ≫
Acot2 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
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