ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Hdac3

Query protein: Hdac3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX4887839 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Hdac3's Target genes

◢ Hdac3: Average

◢ SRX2599799: 3T3-L1

◢ SRX2599800: 3T3-L1

◢ SRX2599801: 3T3-L1

◢ SRX2599802: 3T3-L1

◢ SRX6871352: 3T3-L1

◢ SRX6871353: 3T3-L1

◢ SRX6871354: 3T3-L1

◢ SRX17156728: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156729: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156730: Bone Marrow Cells

◢ SRX17156731: Bone Marrow Cells

◢ SRX21934344: Brown adipocytes

◢ SRX14674610: Brown adipose tissue

◢ SRX14674620: Brown adipose tissue

◢ SRX14674621: Brown adipose tissue

◢ SRX14674622: Brown adipose tissue

◢ SRX14674623: Brown adipose tissue

◢ SRX14674624: Brown adipose tissue

◢ SRX14674625: Brown adipose tissue

◢ SRX14674626: Brown adipose tissue

◢ SRX1890321: Brown adipose tissue

◢ SRX1890322: Brown adipose tissue

◢ SRX3284078: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284079: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284080: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284081: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284082: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284083: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284084: Dorsal root ganglia

◢ SRX3284085: Dorsal root ganglia

◢ ERX2789780: ES cells

◢ ERX2789782: ES cells

◢ ERX2789783: ES cells

◢ ERX2789784: ES cells

◢ ERX2789785: ES cells

◢ ERX2789786: ES cells

◢ SRX4887836: ES cells

◢ SRX4887837: ES cells

◢ SRX4887838: ES cells

◣ SRX4887839: ES cells

◢ SRX1158925: Hippocampus

◢ SRX1158926: Hippocampus

◢ SRX1158927: Hippocampus

◢ SRX1722785: Hippocampus

◢ SRX1722787: Hippocampus

◢ SRX100289: Liver

◢ SRX100290: Liver

◢ SRX100291: Liver

◢ SRX100292: Liver

◢ SRX100293: Liver

◢ SRX2039594: Liver

◢ SRX2039595: Liver

◢ SRX2039596: Liver

◢ SRX2039597: Liver

◢ SRX2039598: Liver

◢ SRX2039599: Liver

◢ SRX206481: Liver

◢ SRX206483: Liver

◢ SRX2375597: Liver

◢ SRX2375598: Liver

◢ SRX2375599: Liver

◢ SRX2375603: Liver

◢ SRX2375604: Liver

◢ SRX2375609: Liver

◢ SRX2375610: Liver

◢ SRX5543268: Liver

◢ SRX5543269: Liver

◢ SRX5543270: Liver

◢ SRX5543271: Liver

◢ SRX5543272: Liver

◢ SRX5543273: Liver

◢ SRX679440: Liver

◢ SRX679441: Liver

◢ SRX679442: Liver

◢ SRX679443: Liver

◢ SRX997769: Liver

◢ SRX997770: Liver

◢ SRX997771: Liver

◢ SRX997772: Liver

◢ SRX997773: Liver

◢ SRX997774: Liver

◢ SRX997775: Liver

◢ SRX997776: Liver

◢ SRX9843666: Lung cancer

◢ SRX9843667: Lung cancer

◢ SRX9843668: Lung cancer

◢ SRX9843669: Lung cancer

◢ SRX9843285: Lung tumors

◢ SRX9843286: Lung tumors

◢ SRX9843287: Lung tumors

◢ SRX9843288: Lung tumors

◢ SRX105109: Macrophages

◢ SRX105110: Macrophages

◢ SRX22541700: Macrophages

◢ SRX22541701: Macrophages

◢ SRX22541702: Macrophages

◢ SRX22541703: Macrophages

◢ SRX5007209: Macrophages

◢ SRX5007210: Macrophages

◢ SRX897073: Macrophages

◢ SRX9702016: Macrophages

◢ SRX9702017: Macrophages

◢ SRX9702018: Macrophages

◢ SRX9702019: Macrophages

◢ SRX9702020: Macrophages

◢ SRX9702021: Macrophages

◢ SRX9702022: Macrophages

◢ SRX9702023: Macrophages

◢ SRX1655669: Pro-B cells

◢ SRX1655670: Pro-B cells

◢ SRX1655671: Pro-B cells

◢ SRX1655672: Pro-B cells

◢ SRX1668641: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668642: Quadriceps Muscle

◢ SRX1668643: Quadriceps Muscle

◢ SRX13365787: RAW 264.7

◢ SRX13365791: RAW 264.7

◢ SRX13365795: RAW 264.7

◢ Hdac3: STRING
Slc39a14 ↻ ≫
Porcn ↻ ≫
Wnt8a ↻ ≫
Ccdc194 ↻ ≫
Pkia ↻ ≫
Cdx1 ↻ ≫
Thbs2 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Cdc42ep4 ↻ ≫
Gadd45g ↻ ≫
Slc7a3 ↻ ≫
Eif4e1b ↻ ≫
Trim36 ↻ ≫
Rhpn2 ↻ ≫
Tmcc1 ↻ ≫
Gm45915 ↻ ≫
Nlrc4 ↻ ≫
Rgs12 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Il33 ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Pccb ↻ ≫
Lpar1 ↻ ≫
Lrrn2 ↻ ≫
Mapk4 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Wnt5b ↻ ≫
Calm5 ↻ ≫
Zfp658 ↻ ≫
Gpc4 ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Cnpy1 ↻ ≫
Tfe3 ↻ ≫
Gprin1 ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Rfx4 ↻ ≫
Fundc1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Krt23 ↻ ≫
Elobl ↻ ≫
Med12 ↻ ≫
Spred1 ↻ ≫
Robo4 ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Upp1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Fubp3 ↻ ≫
Cped1 ↻ ≫
Gm1966 ↻ ≫
Etv5 ↻ ≫
Mobp ↻ ≫
Dido1 ↻ ≫
Gid8 ↻ ≫
Prex1 ↻ ≫
Dppa2 ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Oas1g ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Pde7b ↻ ≫
Vrtn ↻ ≫
Etv1 ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Gm14393 ↻ ≫
Pla2g4e ↻ ≫
Muc13 ↻ ≫
Rtbdn ↻ ≫
Rbm41 ↻ ≫
Stk38 ↻ ≫
Scmh1 ↻ ≫
Tex264 ↻ ≫
Vstm2l ↻ ≫
Lrmp ↻ ≫
Cxcl11 ↻ ≫
Glra1 ↻ ≫
Rlim ↻ ≫
Colgalt1 ↻ ≫
Slc25a53 ↻ ≫
Gjc1 ↻ ≫
Shf ↻ ≫
B4gat1 ↻ ≫
Foxh1 ↻ ≫
Ifitm1 ↻ ≫
Zkscan17 ↻ ≫
1810020O05Rik ↻ ≫
Armcx1 ↻ ≫
Stat4 ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Chd7 ↻ ≫
Trp53bp1 ↻ ≫
Slc43a1 ↻ ≫
Itga1 ↻ ≫
Rbbp7 ↻ ≫
Rif1 ↻ ≫
Shc4 ↻ ≫
Sgk3 ↻ ≫
Car14 ↻ ≫
Ppp2r2b ↻ ≫
Rassf1 ↻ ≫
Golga7b ↻ ≫
Celsr3 ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Scrt1 ↻ ≫
Cd38 ↻ ≫
Iqsec3 ↻ ≫
Lrriq4 ↻ ≫
Lrrc34 ↻ ≫
Hdx ↻ ≫
Scd1 ↻ ≫
Hmgxb4 ↻ ≫
Rpusd2 ↻ ≫
Usp48 ↻ ≫
Adgra2 ↻ ≫
Pmpcb ↻ ≫
Cpsf4l ↻ ≫
Sh2d4b ↻ ≫
Sms ↻ ≫
Zyg11a ↻ ≫
Syncrip ↻ ≫
Slc7a1 ↻ ≫
Ccdc60 ↻ ≫
Xkr7 ↻ ≫
Lypd11 ↻ ≫
Lsm14b ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Noct ↻ ≫
Tg ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
Bnip1 ↻ ≫
Mb21d2 ↻ ≫
Slc12a4 ↻ ≫
Scn1a ↻ ≫
Spry4 ↻ ≫
Liph ↻ ≫
1700008O03Rik ↻ ≫
Pde7a ↻ ≫
Adap1 ↻ ≫
Il1rapl1 ↻ ≫
Mcts1 ↻ ≫
Bcap31 ↻ ≫
Abcd1 ↻ ≫
Slc35f2 ↻ ≫
Ly96 ↻ ≫
Cdkl4 ↻ ≫
Cpeb3 ↻ ≫
Dnah1 ↻ ≫
Ntmt1 ↻ ≫
Rarres1 ↻ ≫
Eif2b5 ↻ ≫
Ptprz1 ↻ ≫
Snx10 ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Map2k6 ↻ ≫
Bmp4 ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Rac1 ↻ ≫
Defb1 ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Akap11 ↻ ≫
Slc7a9 ↻ ≫
Dlgap3 ↻ ≫
Terf1 ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Sst ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Tex50 ↻ ≫
Olfr884 ↻ ≫
Wsb2 ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Bcat1 ↻ ≫
Rnf182 ↻ ≫
Mib2 ↻ ≫
Soga3 ↻ ≫
Mcf2 ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Midn ↻ ≫
Lhx1 ↻ ≫
Plpp1 ↻ ≫
Klhl34 ↻ ≫
Klhl4 ↻ ≫
Sp5 ↻ ≫
Mob3c ↻ ≫
Slc16a9 ↻ ≫
Pou5f1 ↻ ≫
Rab34 ↻ ≫
Ly6g6e ↻ ≫
Hivep3 ↻ ≫
Ptp4a3 ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Rpe ↻ ≫
Wdfy1 ↻ ≫
Fbp2 ↻ ≫
Abcg2 ↻ ≫
Plcxd1 ↻ ≫
Fam111a ↻ ≫
Clk1 ↻ ≫
Tle6 ↻ ≫
Tfpi ↻ ≫
Zfp33b ↻ ≫
Wfikkn1 ↻ ≫
Zfp609 ↻ ≫
Rep15 ↻ ≫
Barhl1 ↻ ≫
Myo18a ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Dmc1 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Insyn2b ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Dtd1 ↻ ≫
Mrpl37 ↻ ≫
Cyb5rl ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Fam118a ↻ ≫
Fbxo27 ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
Zfp608 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Tjp2 ↻ ≫
Amd2 ↻ ≫
Amd1 ↻ ≫
Ubr5 ↻ ≫
Ido1 ↻ ≫
Gipc2 ↻ ≫
1700019D03Rik ↻ ≫
Pkd2 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Mylpf ↻ ≫
Tcea3 ↻ ≫
Slc12a8 ↻ ≫
Neurog1 ↻ ≫
Slc31a2 ↻ ≫
Wdr45 ↻ ≫
Spp1 ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Zcrb1 ↻ ≫
Pphln1 ↻ ≫
Kcnj8 ↻ ≫
Tgm3 ↻ ≫
Wdr82 ↻ ≫
Pcdhgc4 ↻ ≫
Snap25 ↻ ≫
Prrt3 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13275 ↻ ≫
Prps1 ↻ ≫
Otx2 ↻ ≫
Praf2 ↻ ≫
Zp3 ↻ ≫
Fam189a1 ↻ ≫
2410141K09Rik ↻ ≫
H2bc22 ↻ ≫
H2ac22 ↻ ≫
Lrpap1 ↻ ≫
Acp6 ↻ ≫
Runx1t1 ↻ ≫
Atoh1 ↻ ≫
Slc12a2 ↻ ≫
Flot1 ↻ ≫
Nhsl1 ↻ ≫
Cyb561 ↻ ≫
Ccdc28b ↻ ≫
Fbxo15 ↻ ≫
Hlf ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Vegfc ↻ ≫
Tafa3 ↻ ≫
N4bp2 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Tango2 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Rxrg ↻ ≫
Rdx ↻ ≫
Gm11563 ↻ ≫
Mdk ↻ ≫
Hmces ↻ ≫
Lrrn4 ↻ ≫
Zfp182 ↻ ≫
Erdr1 ↻ ≫
Patj ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
Mreg ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Smarca5 ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Cysltr1 ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Pglyrp1 ↻ ≫
Ywhaz ↻ ≫
Spint1 ↻ ≫
Kctd4 ↻ ≫
Trpm1 ↻ ≫
Msl2 ↻ ≫
Smc6 ↻ ≫
Gen1 ↻ ≫
Cep112 ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Sulf1 ↻ ≫
Mroh6 ↻ ≫
Tigd2 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
4833439L19Rik ↻ ≫
Slc23a2 ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Gzma ↻ ≫
Emilin2 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Serinc5 ↻ ≫
Fhit ↻ ≫
Hhla1 ↻ ≫
Anapc4 ↻ ≫
Tulp4 ↻ ≫
Mad1l1 ↻ ≫
Qars ↻ ≫
Col13a1 ↻ ≫
Scn2b ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Prmt6 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Tpcn2 ↻ ≫
Stmn1 ↻ ≫
Rps23rg1 ↻ ≫
Rasgef1a ↻ ≫
Arntl ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
Slc6a7 ↻ ≫
Dennd2c ↻ ≫
Myo5a ↻ ≫
Shisa5 ↻ ≫
Enpp4 ↻ ≫
Itgb6 ↻ ≫
Ntn4 ↻ ≫
Glra2 ↻ ≫
1700102P08Rik ↻ ≫
Frzb ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Mllt6 ↻ ≫
Laptm4b ↻ ≫
Pgap6 ↻ ≫
Fam162a ↻ ≫
Ccdc58 ↻ ≫
Pmvk ↻ ≫
Prdm14 ↻ ≫
Syngr1 ↻ ≫
Tdrd7 ↻ ≫
L3mbtl2 ↻ ≫
Tulp2 ↻ ≫
Tmem131l ↻ ≫
Fbxw10 ↻ ≫
Atp5j2 ↻ ≫
Cryba4 ↻ ≫
Nrd1 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
Loxl3 ↻ ≫
Dok1 ↻ ≫
Oas1a ↻ ≫
Cdh10 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Gm29802 ↻ ≫
Cd109 ↻ ≫
Gjb3 ↻ ≫
Dusp4 ↻ ≫
Spsb4 ↻ ≫
Serpina3i ↻ ≫
Fam169b ↻ ≫
Gm1070 ↻ ≫
Plekhf2 ↻ ≫
Cast ↻ ≫
Lcor ↻ ≫
Uba2 ↻ ≫
Kdm3a ↻ ≫
Themis ↻ ≫
Trim66 ↻ ≫
Nppb ↻ ≫
Elovl6 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Mapk8ip2 ↻ ≫
Lrrtm3 ↻ ≫
Impdh2 ↻ ≫
Agtrap ↻ ≫
Dock11 ↻ ≫
Ndrg4 ↻ ≫
Efcab10 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Ube2d2a ↻ ≫
Abcb7 ↻ ≫
Pelp1 ↻ ≫
Klhdc7a ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Gchfr ↻ ≫
Thsd4 ↻ ≫
Zmat5 ↻ ≫
Uqcr10 ↻ ≫
Slc27a3 ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Dctn2 ↻ ≫
Adgrg6 ↻ ≫
Krt222 ↻ ≫
Etv4 ↻ ≫
Arhgef39 ↻ ≫
Foxr2 ↻ ≫
4921509C19Rik ↻ ≫
Usp9x ↻ ≫
Igf1 ↻ ≫
Sypl2 ↻ ≫
Pvr ↻ ≫
Habp4 ↻ ≫
Ryr2 ↻ ≫
Ino80c ↻ ≫
Brd2 ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Grk3 ↻ ≫
Phc2 ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Lpar6 ↻ ≫
Icam1 ↻ ≫
Rab38 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Mcc ↻ ≫
Slc2a9 ↻ ≫
Ccdc158 ↻ ≫
Fgfbp1 ↻ ≫
Dennd6a ↻ ≫
Dnajc6 ↻ ≫
BC028528 ↻ ≫
Elmo2 ↻ ≫
C330007P06Rik ↻ ≫
Gm3752 ↻ ≫
Asb8 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Arhgap35 ↻ ≫
Tinagl1 ↻ ≫
Trappc9 ↻ ≫
Ripk3 ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Stk40 ↻ ≫
Usp27x ↻ ≫
Mrps23 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Ubl3 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Frrs1 ↻ ≫
Kank1 ↻ ≫
Srrm4 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
Polm ↻ ≫
Gdi1 ↻ ≫
Fzd2 ↻ ≫
Notch4 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Btla ↻ ≫
Dkk4 ↻ ≫
Plaur ↻ ≫
Cpne2 ↻ ≫
Zfp976 ↻ ≫
Myadml2 ↻ ≫
Rhox9 ↻ ≫
Morf4l2 ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Fmr1nb ↻ ≫
Wscd2 ↻ ≫
Pipox ↻ ≫
Gsta4 ↻ ≫
Cerkl ↻ ≫
Stmn2 ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Arl15 ↻ ≫
Tpd52 ↻ ≫
Trmt44 ↻ ≫
Rnf220 ↻ ≫
Macroh2a1 ↻ ≫
Trim71 ↻ ≫
Nucks1 ↻ ≫
Rnf125 ↻ ≫
Il25 ↻ ≫
Rnase2b ↻ ≫
Mrps15 ↻ ≫
Gpr1 ↻ ≫
Slc35f5 ↻ ≫
Oplah ↻ ≫
Zfp819 ↻ ≫
Sars ↻ ≫
Triml2 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Slc39a4 ↻ ≫
Dll3 ↻ ≫
Mpc1 ↻ ≫
Fam124b ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Nadsyn1 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Tbrg1 ↻ ≫
Sbk1 ↻ ≫
Lamb2 ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Hsd17b11 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Nr5a2 ↻ ≫
Ccnd3 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Mrps33 ↻ ≫
Dock7 ↻ ≫
Tlnrd1 ↻ ≫
Spry2 ↻ ≫
Rnaseh2a ↻ ≫
Igdcc3 ↻ ≫
Gm1096 ↻ ≫
Nono ↻ ≫
Fbll1 ↻ ≫
Dhrs3 ↻ ≫
Fabp3 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Calu ↻ ≫
Wbp11 ↻ ≫
Faim ↻ ≫
Mlh3 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Prdx1 ↻ ≫
Bmp8a ↻ ≫
Zfp977 ↻ ≫
Cd37 ↻ ≫
Fam20a ↻ ≫
Acot9 ↻ ≫
Hesx1 ↻ ≫
Sptbn2 ↻ ≫
Fam169a ↻ ≫
Kcnf1 ↻ ≫
Trim6 ↻ ≫
Irf2bpl ↻ ≫
Dhrs13 ↻ ≫
Kcnb1 ↻ ≫
Gm13286 ↻ ≫
Cecr2 ↻ ≫
Gm13212 ↻ ≫
Ripply1 ↻ ≫
Efcab2 ↻ ≫
Zfp948 ↻ ≫
Psors1c2 ↻ ≫
Msh6 ↻ ≫
B3gnt3 ↻ ≫
Cited4 ↻ ≫
Slc30a2 ↻ ≫
Serpinb6c ↻ ≫
Slc13a2 ↻ ≫
Fam110a ↻ ≫
Cbx1 ↻ ≫
Mkrn1 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Ndst1 ↻ ≫
Pald1 ↻ ≫
Donson ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Spdye4c ↻ ≫
Thoc2 ↻ ≫
Krcc1 ↻ ≫
Rprd2 ↻ ≫
Mri1 ↻ ≫
Nsdhl ↻ ≫
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Sfi1 ↻ ≫
Arhgap42 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Lekr1 ↻ ≫
Phf5a ↻ ≫
Aco2 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
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Gls ↻ ≫
Abcb6 ↻ ≫
Nanog ↻ ≫
Eda2r ↻ ≫
Prkg2 ↻ ≫
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