ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX11237502 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◣ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Rpl30 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
H2bc18 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H1f5 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Ap3s2 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
Zc3h10 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Drg2 ↻ ≫
Hus1 ↻ ≫
Ttc4 ↻ ≫
H4c8 ↻ ≫
Gtf3c3 ↻ ≫
H4c6 ↻ ≫
H3c10 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Ncam1 ↻ ≫
Cyb5r1 ↻ ≫
H3c13 ↻ ≫
H3c8 ↻ ≫
Rnf225 ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Fra10ac1 ↻ ≫
Dclre1b ↻ ≫
Ap4b1 ↻ ≫
H2bc1 ↻ ≫
H2ac1 ↻ ≫
Tbc1d7 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Trip12 ↻ ≫
Fbxo36 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
H4c12 ↻ ≫
Insr ↻ ≫
H3c11 ↻ ≫
B3galt4 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
H3c3 ↻ ≫
Them4 ↻ ≫
H3c2 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Coasy ↻ ≫
H2ac21 ↻ ≫
H2bc21 ↻ ≫
H2ac20 ↻ ≫
Taco1 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Vamp1 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
Golga7b ↻ ≫
Kmt2d ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Ppp1r10 ↻ ≫
Snapc5 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Sumf2 ↻ ≫
Mtg1 ↻ ≫
Sar1b ↻ ≫
5730455P16Rik ↻ ≫
Chrnb2 ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
H2bc4 ↻ ≫
H2ac6 ↻ ≫
Dnajb14 ↻ ≫
H1f1 ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Pus10 ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Chgb ↻ ≫
Scg3 ↻ ≫
H2bc9 ↻ ≫
Acsf3 ↻ ≫
1700001P01Rik ↻ ≫
Slc39a3 ↻ ≫
Etfbkmt ↻ ≫
Dnajb12 ↻ ≫
H4c2 ↻ ≫
Svop ↻ ≫
Ccdc57 ↻ ≫
Mrpl58 ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
Ptcd2 ↻ ≫
Mrps27 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Mrps18c ↻ ≫
Helq ↻ ≫
Plekhm3 ↻ ≫
Nudcd3 ↻ ≫
Tatdn3 ↻ ≫
Nsl1 ↻ ≫
Speer4f1 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
Cd68 ↻ ≫
Ndufaf1 ↻ ≫
Gtf3c5 ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Cacng3 ↻ ≫
Grm2 ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Kcnb1 ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Sec13 ↻ ≫
Rph3a ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Atat1 ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
H4c1 ↻ ≫
H3c1 ↻ ≫
Zmpste24 ↻ ≫
Glra1 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Rbck1 ↻ ≫
H2ax ↻ ≫
Tyw5 ↻ ≫
Maip1 ↻ ≫
Cops8 ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Tmem101 ↻ ≫
Mrpl3 ↻ ≫
H2bc14 ↻ ≫
Agk ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Polr3b ↻ ≫
Alkbh3 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Slc33a1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Zfp738 ↻ ≫
Rptor ↻ ≫
Pcyt1a ↻ ≫
Barhl1 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Sp3 ↻ ≫
Nras ↻ ≫
Vps25 ↻ ≫
Tbrg1 ↻ ≫
Vangl2 ↻ ≫
Vps28 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
Scn3b ↻ ≫
Resp18 ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Rps11 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Chmp2a ↻ ≫
Txn2 ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Lrriq3 ↻ ≫
Fpgt ↻ ≫
Ddx56 ↻ ≫
Ndufs3 ↻ ≫
Kbtbd4 ↻ ≫
Scamp3 ↻ ≫
Prm1 ↻ ≫
Cenps ↻ ≫
H2bc8 ↻ ≫
H2ac8 ↻ ≫
Cipc ↻ ≫
Tti2 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Casz1 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Kdm3a ↻ ≫
Mrpl21 ↻ ≫
Ighmbp2 ↻ ≫
Tor1a ↻ ≫
Cct4 ↻ ≫
Slc22a21 ↻ ≫
Polg2 ↻ ≫
Zfp41 ↻ ≫
Ppil3 ↻ ≫
Nif3l1 ↻ ≫
Ppip5k2 ↻ ≫
Gin1 ↻ ≫
H2bc15 ↻ ≫
H2ac15 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Zfp11 ↻ ≫
Ddx18 ↻ ≫
Krr1 ↻ ≫
Stat1 ↻ ≫
Ube2z ↻ ≫
Zfp119b ↻ ≫
Mpzl3 ↻ ≫
Cnga3 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Bms1 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Vwc2l ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Mterf4 ↻ ≫
Tars2 ↻ ≫
Slc25a39 ↻ ≫
Grin1 ↻ ≫
Zfp647 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Stoml2 ↻ ≫
Rgl2 ↻ ≫
Tnfrsf1b ↻ ≫
Gpr157 ↻ ≫
Zfand3 ↻ ≫
Kat8 ↻ ≫
Nelfb ↻ ≫
Ccdc92b ↻ ≫
Snx15 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Smg8 ↻ ≫
Pigm ↻ ≫
Ccni ↻ ≫
2010109A12Rik ↻ ≫
Btbd8 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Etfrf1 ↻ ≫
Casc1 ↻ ≫
Msh4 ↻ ≫
Eif4a2 ↻ ≫
Pradc1 ↻ ≫
Cct7 ↻ ≫
Marchf4 ↻ ≫
Ptprn ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Zfp729a ↻ ≫
Dynlt1b ↻ ≫
Fam133b ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Snx19 ↻ ≫
Gnb2 ↻ ≫
Eif4a1 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Scfd1 ↻ ≫
Yipf5 ↻ ≫
Dner ↻ ≫
H2aw ↻ ≫
Mnat1 ↻ ≫
Rpp21 ↻ ≫
Cpt1c ↻ ≫
Epn1 ↻ ≫
Yipf2 ↻ ≫
Timm29 ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Mrpl12 ↻ ≫
Mtmr9 ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Srsf1 ↻ ≫
Mrps15 ↻ ≫
Ndufc1 ↻ ≫
Gdap1 ↻ ≫
Blmh ↻ ≫
4930404N11Rik ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Nme6 ↻ ≫
Pcid2 ↻ ≫
Cul4a ↻ ≫
2310033P09Rik ↻ ≫
Nat10 ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Rad50 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Crem ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Mtif2 ↻ ≫
Sec22b ↻ ≫
Commd2 ↻ ≫
Cntnap5b ↻ ≫
Znrd1 ↻ ≫
Znrd1as ↻ ≫
Vps51 ↻ ≫
Gramd2 ↻ ≫
Clpx ↻ ≫
Thg1l ↻ ≫
Zpbp2 ↻ ≫
Stxbp5l ↻ ≫
Tatdn1 ↻ ≫
Ndufb9 ↻ ≫
Pih1d2 ↻ ≫
Nkapd1 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Nufip2 ↻ ≫
Elobl ↻ ≫
Nek4 ↻ ≫
Kmt5b ↻ ≫
Tmem179b ↻ ≫
Irf2 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
1810009A15Rik ↻ ≫
Afmid ↻ ≫
Tk1 ↻ ≫
Psmg1 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Synj1 ↻ ≫
Actl6a ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Lyrm9 ↻ ≫
Asrgl1 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Hemk1 ↻ ≫
Rsl24d1 ↻ ≫
Actr3 ↻ ≫
Mrps31 ↻ ≫
Ints12 ↻ ≫
Gstcd ↻ ≫
Serhl ↻ ≫
Zc3h11a ↻ ≫
Zbed6 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
H2bc3 ↻ ≫
Iqsec3 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Srp19 ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Fam219b ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
4931408C20Rik ↻ ≫
Ngdn ↻ ≫
Zfp963 ↻ ≫
Pfkm ↻ ≫
Senp1 ↻ ≫
Rfx8 ↻ ≫
Hexim1 ↻ ≫
Trim41 ↻ ≫
Ndc80 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
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8030462N17Rik ↻ ≫
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