ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2400136 | CD4 CD8 double negative cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◣ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Cxcr4 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Ccr1l1 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Pfn4 ↻ ≫
Fam228b ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Lyrm7 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
St8sia1 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Zfp704 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Tamm41 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Mex3b ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Nck1 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Glipr2 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Icosl ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Ddit4 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Tent5a ↻ ≫
Gimap8 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Lrrc59 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Ifng ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Inhba ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Itga4 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Iqgap2 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Slfn10-ps ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Ccdc71l ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Erfe ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Rpp30 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Dtwd2 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Tpbgl ↻ ≫
Gatad1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Dusp10 ↻ ≫
1700056E22Rik ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Npc1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Serpinb9 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Ephb6 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Mei4 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Arrb2 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Zfp51 ↻ ≫
Dhx34 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Irak3 ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
S100a6 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Ntrk1 ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
Insrr ↻ ≫
Zfp54 ↻ ≫
Gfm1 ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Jun ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Zpbp ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Gimap5 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Ogfod2 ↻ ≫
Cabyr ↻ ≫
Agfg1 ↻ ≫
Rfx2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Ints1 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Flt3l ↻ ≫
Dipk1a ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Tbc1d9b ↻ ≫
Myof ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Bclaf3 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Thbs1 ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Cdkn2b ↻ ≫
Ppp1r3b ↻ ≫
Nyap1 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Cbwd1 ↻ ≫
Exosc6 ↻ ≫
4930402F06Rik ↻ ≫
Erap1 ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Prag1 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Inka1 ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Rasal1 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Scai ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Map3k5 ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Pdrg1 ↻ ≫
Prpf18 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Limk2 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
Cplane2 ↻ ≫
Cdc14a ↻ ≫
Cd2bp2 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Cenpb ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Tigd2 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Wiz ↻ ≫
Rtn4rl1 ↻ ≫
Oscar ↻ ≫
Ndufa3 ↻ ≫
Ajuba ↻ ≫
Atp1a1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Tex48 ↻ ≫
Usf2 ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Ddo ↻ ≫
Suox ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Slc24a3 ↻ ≫
Clpb ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Rrp1 ↻ ≫
Rprm ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Tsc22d1 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Rbp7 ↻ ≫
Gtsf1l ↻ ≫
Ppp6r2 ↻ ≫
Mei1 ↻ ≫
Pagr1a ↻ ≫
Tcf7l2 ↻ ≫
Ythdf2 ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
H6pd ↻ ≫
Def8 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Plekhg5 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
Spag1 ↻ ≫
Slc25a22 ↻ ≫
LOC114841036 ↻ ≫
Fkbp2 ↻ ≫
Camta2 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Gask1b ↻ ≫
Sema4c ↻ ≫
Rftn1 ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
Dnlz ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Gtpbp4 ↻ ≫
Phlpp1 ↻ ≫
Vsir ↻ ≫
Stxbp3 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Dhx57 ↻ ≫
Morn2 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Cenps ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Lsmem1 ↻ ≫
Cab39 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Snapc5 ↻ ≫
Klf6 ↻ ≫
Rps6ka5 ↻ ≫
Ccl9 ↻ ≫
Ankle1 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Suclg1 ↻ ≫
Zbtb45 ↻ ≫
Oma1 ↻ ≫
Il20ra ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
B3gnt9 ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Lamc1 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Tns1 ↻ ≫
Rufy4 ↻ ≫
Matn2 ↻ ≫
Cnn3 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Mrvi1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Fam83h ↻ ≫
Cyp11a1 ↻ ≫
Mettl27 ↻ ≫
Cdc42bpg ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Bambi ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Fam220a ↻ ≫
Poc1b ↻ ≫
Galnt4 ↻ ≫
Spred1 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Sec31b ↻ ≫
Ttc21b ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
M1ap ↻ ≫
Cog1 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Ddah2 ↻ ≫
Sh3pxd2a ↻ ≫
Tmem208 ↻ ≫
Lrrc29 ↻ ≫
B3gnt2 ↻ ≫
Fuz ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
E130311K13Rik ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Lrrn3 ↻ ≫
Stum ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Ndufc1 ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Flnb ↻ ≫
Togaram2 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Fut7 ↻ ≫
Mllt1 ↻ ≫
Cracr2a ↻ ≫
Il18r1 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Kctd18 ↻ ≫
Hs3st1 ↻ ≫
Fchsd2 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Pik3r5 ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Hapln2 ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Pcgf1 ↻ ≫
Tdrd7 ↻ ≫
Afmid ↻ ≫
Als2 ↻ ≫
Tk1 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Senp3 ↻ ≫
Ppp2cb ↻ ≫
Stx3 ↻ ≫
Phldb1 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Pacsin2 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
Nrp1 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Kcnk13 ↻ ≫
Lrrk1 ↻ ≫
Pigo ↻ ≫
Vps4a ↻ ≫
Nfkbil1 ↻ ≫
Atp6v1g2 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Prnd ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Fem1a ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Ect2l ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
Smc3 ↻ ≫
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