ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3197481 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◣ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Acbd4 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Alox12e ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Fh1 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Dner ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
1700018F24Rik ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Fam161a ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Abr ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Tph2 ↻ ≫
Tns1 ↻ ≫
Rufy4 ↻ ≫
Tcerg1l ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Hebp2 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Pola2 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Cgnl1 ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Dcdc5 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Ppfia4 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Fgfr2 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Tmem92 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Pax2 ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Lrrn3 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Disp3 ↻ ≫
Aox3 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Rab27a ↻ ≫
Stra8 ↻ ≫
Cog1 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Mc3r ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Aadat ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Ccdc85a ↻ ≫
Rpp30 ↻ ≫
Efnb1 ↻ ≫
Pcdhga12 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Dpp6 ↻ ≫
Sox15 ↻ ≫
B3gat2 ↻ ≫
Ntrk2 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Pcdhac1 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Htr1a ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Trpm5 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Hbq1a ↻ ≫
Lrrc66 ↻ ≫
Klhdc9 ↻ ≫
Slco2b1 ↻ ≫
Ntrk1 ↻ ≫
Insrr ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Fmod ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
Aipl1 ↻ ≫
Cfap97d1 ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Stum ↻ ≫
Fis1 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Fam83h ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Sema5b ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Ush1g ↻ ≫
Otop2 ↻ ≫
Atp2c1 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Elapor1 ↻ ≫
1700013F07Rik ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
H3c3 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Nxn ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
Slc9a4 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
H2bc4 ↻ ≫
H2ac6 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Cebpd ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
Bicdl2 ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Gtsf1l ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Deptor ↻ ≫
Mgst3 ↻ ≫
Spock1 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Olig2 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Pex10 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Ppp1r14a ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Trim69 ↻ ≫
Arhgef1 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Adra2a ↻ ≫
Crhr1 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Npy1r ↻ ≫
Slco5a1 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Ocm ↻ ≫
Ascl5 ↻ ≫
Rbm46 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Vps35l ↻ ≫
Hapln2 ↻ ≫
Ccdc42 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Senp3 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Dnajc22 ↻ ≫
5730507C01Rik ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Pomk ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Gm10634 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Stk11 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Psg19 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
Nt5c1a ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Flt3l ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Gad1 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Cryba2 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Sec31b ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Stx3 ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Tshr ↻ ≫
Zfp954 ↻ ≫
Erich6b ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Slc35e4 ↻ ≫
H2bc18 ↻ ≫
H3c13 ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Grm4 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Magel2 ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Elf3 ↻ ≫
Ccdc126 ↻ ≫
Rpl37rt ↻ ≫
Zfp54 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Als2 ↻ ≫
Zfp74 ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Prnd ↻ ≫
Tfap2c ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
Calcoco2 ↻ ≫
Rasal1 ↻ ≫
Nme6 ↻ ≫
H1f5 ↻ ≫
Fam241b ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Ttll1 ↻ ≫
Tmem167b ↻ ≫
Rprm ↻ ≫
Tgfb1i1 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
H3c2 ↻ ≫
Prss57 ↻ ≫
Myog ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Samd4b ↻ ≫
Gmfg ↻ ≫
Insyn2b ↻ ≫
Cd68 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
C1ra ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
C1rl ↻ ≫
Hsd17b6 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Fgf18 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Cldn1 ↻ ≫
Zfp251 ↻ ≫
Cfap100 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Rnasel ↻ ≫
Gstm6 ↻ ≫
Slfn10-ps ↻ ≫
Aldh1a2 ↻ ≫
Tha1 ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Ttc21b ↻ ≫
Hunk ↻ ≫
Rph3al ↻ ≫
Zbtb45 ↻ ≫
Isoc2b ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
H4c6 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Bdh2 ↻ ≫
Fam131b ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Rbpjl ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Ddo ↻ ≫
Gfi1b ↻ ≫
Rtn2 ↻ ≫
Rgs20 ↻ ≫
Clptm1 ↻ ≫
Gm3558 ↻ ≫
Kcnk15 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Otos ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Lix1 ↻ ≫
H3c11 ↻ ≫
H4c12 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
H3c8 ↻ ≫
Zfp345 ↻ ≫
Btbd16 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
Lrch1 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Bdnf ↻ ≫
Yeats4 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Mro ↻ ≫
B3gnt9 ↻ ≫
Inpp4b ↻ ≫
Trpc3 ↻ ≫
Slitrk5 ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Gcnt1 ↻ ≫
Fhdc1 ↻ ≫
Zfp952 ↻ ≫
Zfp729a ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Mrvi1 ↻ ≫
Cdkn2b ↻ ≫
Acot11 ↻ ≫
Tnr ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Flnb ↻ ≫
Scai ↻ ≫
Grm8 ↻ ≫
Cwf19l2 ↻ ≫
C130074G19Rik ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Nlrx1 ↻ ≫
Gli1 ↻ ≫
Snapc5 ↻ ≫
Fbxl22 ↻ ≫
H4c1 ↻ ≫
H3c1 ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Mcidas ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Fut7 ↻ ≫
Mllt1 ↻ ≫
Prlhr ↻ ≫
4930402F06Rik ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Edn1 ↻ ≫
Fhod3 ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Adora2a ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
Inhbe ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Ctdsp1 ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Rcan2 ↻ ≫
H2ac21 ↻ ≫
H2bc21 ↻ ≫
H2ac20 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
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Nme1 ↻ ≫
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