ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3946269 | C2C12
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◣ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Hook2 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Col6a2 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Mertk ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Tomm5 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Ehd3 ↻ ≫
N4bp2l2 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Tsc22d1 ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Pcdhgb8 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Tafa5 ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Taf15 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Ttll1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Adam5 ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Afmid ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Ngdn ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
4930402F06Rik ↻ ≫
Sufu ↻ ≫
Actr1a ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Gdf5 ↻ ≫
Dapk2 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Tmem201 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Nectin1 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Rfc2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Casp2 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Aadat ↻ ≫
BC004004 ↻ ≫
Cnep1r1 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Haus7 ↻ ≫
Rtn4r ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Tbc1d4 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
Psmd11 ↻ ≫
Has2 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
Uqcc2 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Pex10 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Ankrd44 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Nck1 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Prmt3 ↻ ≫
Cyp11a1 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Deptor ↻ ≫
Bpi ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Tmem106c ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Efnb1 ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Zfp251 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Hsd17b6 ↻ ≫
Otos ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Flt3l ↻ ≫
Pds5b ↻ ≫
Tcaf2 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Rrp9 ↻ ≫
Parp3 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Asb16 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Decr2 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Flnb ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Rhoc ↻ ≫
Garem1 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Lmtk2 ↻ ≫
Pdrg1 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Farp1 ↻ ≫
Depdc1b ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Cdc14b ↻ ≫
Rtn4rl1 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
Fbxo32 ↻ ≫
Nxn ↻ ≫
Tcim ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Flvcr2 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Als2 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Matn2 ↻ ≫
Ror1 ↻ ≫
Eml1 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Rpl18a ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Bdh2 ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Prnd ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
Limk2 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Dnm1 ↻ ≫
Rpp30 ↻ ≫
Phlpp1 ↻ ≫
Tas1r1 ↻ ≫
Nol9 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Erap1 ↻ ≫
Faf2 ↻ ≫
Nhej1 ↻ ≫
Rxfp3 ↻ ≫
Med18 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Mrpl11 ↻ ≫
Pknox2 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Pop5 ↻ ≫
Cfap97d1 ↻ ≫
Npc1 ↻ ≫
Pfn4 ↻ ≫
Fam228b ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
Cenpc1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
B4galt6 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Alkbh4 ↻ ≫
Slc16a11 ↻ ≫
Lrwd1 ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Lig4 ↻ ≫
Asf1b ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Tap2 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Pdgfra ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Uckl1 ↻ ≫
Neu2 ↻ ≫
Rbis ↻ ≫
Rpp14 ↻ ≫
Htd2 ↻ ≫
Lix1 ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Elf3 ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Tlr6 ↻ ≫
Sys1 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Nrg1 ↻ ≫
Calhm5 ↻ ≫
Calr ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Upf3a ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Cars2 ↻ ≫
Car2 ↻ ≫
Atg16l1 ↻ ≫
Fra10ac1 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Apba1 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
Gab1 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Acaa1b ↻ ≫
Nop14 ↻ ≫
Grk4 ↻ ≫
Antxr1 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Ppm1j ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Gdnf ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Hrob ↻ ≫
Glipr2 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Lpin3 ↻ ≫
Lsm2 ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
Myof ↻ ≫
Pld2 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Thbs1 ↻ ≫
Rnf214 ↻ ≫
Pcsk7 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Mad2l2 ↻ ≫
Gli1 ↻ ≫
Srp19 ↻ ≫
Stk11 ↻ ≫
Fam83d ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Pigo ↻ ≫
Adra2a ↻ ≫
Tlr2 ↻ ≫
Col5a1 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Creb3l1 ↻ ≫
Zfp54 ↻ ≫
Yars2 ↻ ≫
Zfp729a ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Oma1 ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Kifc2 ↻ ≫
Prss57 ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Ptgfr ↻ ≫
Snapin ↻ ≫
2700081O15Rik ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Tcp11 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
Rab13 ↻ ≫
Tlcd1 ↻ ≫
Hmg20b ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
Fem1a ↻ ≫
R3hcc1 ↻ ≫
C2cd4b ↻ ≫
Gadd45a ↻ ≫
Pcdhgc3 ↻ ≫
Pex7 ↻ ≫
D030056L22Rik ↻ ≫
Adam12 ↻ ≫
Ndufaf6 ↻ ≫
Kazald1 ↻ ≫
Gjc2 ↻ ≫
Stim1 ↻ ≫
Ube2l6 ↻ ≫
Twistnb ↻ ≫
Psmc3ip ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Rbm15b ↻ ≫
Mmp17 ↻ ≫
Aurkaip1 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Ap5b1 ↻ ≫
Tpgs1 ↻ ≫
Ints1 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Ess2 ↻ ≫
Tsc22d3 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Ndufc1 ↻ ≫
Sh3pxd2a ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Mtf1 ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Hdac10 ↻ ≫
Mrpl33 ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Dipk1a ↻ ≫
Csgalnact1 ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
C1ra ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
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