ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX2400138 | CD4 CD8 double negative cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◢ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◣ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Irak2 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Ramp1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Ccr1l1 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Lrrc59 ↻ ≫
Pfn4 ↻ ≫
Fam228b ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Crh ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Map3k5 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Icosl ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Timp2 ↻ ≫
Usf2 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Slc1a4 ↻ ≫
Atxn7l1 ↻ ≫
Rapgef3 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Rps6ka5 ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
St8sia1 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Gimap8 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Rprm ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Atp1a1 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Dipk1a ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Mei4 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Enc1 ↻ ≫
Bcr ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Ppp1r3b ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Agfg1 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Ddah2 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Mtdh ↻ ≫
Lyrm7 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Arrb2 ↻ ≫
Ddit4 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Mex3b ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
B3gnt9 ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Serpinb9 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Glipr2 ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Lsmem1 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Matn2 ↻ ≫
Slc24a3 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Rftn1 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Plekhg5 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Tpbgl ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Cdkn2b ↻ ≫
Cplane2 ↻ ≫
Rpp30 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Setbp1 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Cd160 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Camk2d ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
LOC114841036 ↻ ≫
Fkbp2 ↻ ≫
Kcnk13 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Mob3b ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Ccdc71l ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Tap2 ↻ ≫
Lamc1 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Stum ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Gm13288 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Tamm41 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Magix ↻ ≫
Itga4 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Ankle1 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
4921528I07Rik ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Smap2 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Pofut1 ↻ ≫
Plagl2 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Dnmt3a ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Dhx57 ↻ ≫
Morn2 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Inhba ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
M1ap ↻ ≫
Hsd17b14 ↻ ≫
Zpbp ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Abca2 ↻ ≫
Nck1 ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Erfe ↻ ≫
Dusp10 ↻ ≫
1700056E22Rik ↻ ≫
Dmtn ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Ifng ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Cxcr4 ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Tfeb ↻ ≫
Cbwd1 ↻ ≫
Dhx34 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Tex48 ↻ ≫
Cracr2a ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Mfhas1 ↻ ≫
Ephb6 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Trib3 ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Irak3 ↻ ≫
Gm13286 ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Gask1b ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Camta2 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Fam98b ↻ ≫
Runx2 ↻ ≫
Poc1b ↻ ≫
Galnt4 ↻ ≫
Rab27a ↻ ≫
Bambi ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Ets2 ↻ ≫
Lbh ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
H6pd ↻ ≫
Gpr160 ↻ ≫
Prag1 ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Dtx3l ↻ ≫
Pacsin2 ↻ ≫
Wdr41 ↻ ≫
Akt1 ↻ ≫
Golgb1 ↻ ≫
Camk1d ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Cdc14a ↻ ≫
Rbpjl ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Pfkfb3 ↻ ≫
Rnf34 ↻ ≫
Upf3a ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Ajuba ↻ ≫
Prss32 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Prickle4 ↻ ≫
Frs3 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Vps13d ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Mrpl33 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Rnf144a ↻ ≫
Tmtc2 ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Mtrf1l ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Npdc1 ↻ ≫
Irf9 ↻ ≫
Prr5l ↻ ≫
Smim12 ↻ ≫
Flt3l ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Extl3 ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Irf7 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Bms1 ↻ ≫
Ankrd44 ↻ ≫
Bcl2l11 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Gng2 ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Wiz ↻ ≫
Lrrn3 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Wnt11 ↻ ≫
Thbs1 ↻ ≫
Fchsd2 ↻ ≫
Il20ra ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Ptms ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
B3gnt2 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Zfp202 ↻ ≫
Ddx47 ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Car13 ↻ ≫
Prkcq ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Pagr1a ↻ ≫
Slfn10-ps ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Dtwd2 ↻ ≫
Tmem44 ↻ ≫
Slco3a1 ↻ ≫
S100a6 ↻ ≫
Midn ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Fam83h ↻ ≫
Kcng3 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Nxnl2 ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Cav1 ↻ ≫
Tmem50a ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Disp3 ↻ ≫
Nt5c1a ↻ ≫
Ptprv ↻ ≫
Ptpn7 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Cdh22 ↻ ≫
Lmtk2 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Noc3l ↻ ≫
Hapln2 ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Def8 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Elf3 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Lrrc8a ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Ccdc142 ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Fut7 ↻ ≫
Cxcl3 ↻ ≫
Edn1 ↻ ≫
Psip1 ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Ect2l ↻ ≫
Pop7 ↻ ≫
B3glct ↻ ≫
Inpp4b ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Apba1 ↻ ≫
Rdh10 ↻ ≫
Pih1d1 ↻ ≫
Aldh16a1 ↻ ≫
Klf6 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Tbc1d9b ↻ ≫
Prdm1 ↻ ≫
Slc29a3 ↻ ≫
Ptger2 ↻ ≫
E130311K13Rik ↻ ≫
Garnl3 ↻ ≫
Hs3st1 ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Atp8b2 ↻ ≫
Eif2ak1 ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Abhd18 ↻ ≫
Smco4 ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Mctp1 ↻ ≫
Rasal1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Mycn ↻ ≫
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