ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc3

Query protein: Smc3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3946267 | C2C12
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc3's Target genes

◢ Smc3: Average

◢ SRX218285: B cells

◢ SRX218289: B cells

◢ SRX3753596: B cells

◢ SRX3753597: B cells

◢ SRX3753598: B cells

◢ SRX3753599: B cells

◢ SRX3753600: B cells

◢ SRX3753601: B cells

◢ SRX3946265: C2C12

◣ SRX3946267: C2C12

◢ SRX3946269: C2C12

◢ SRX3946271: C2C12

◢ SRX3946273: C2C12

◢ SRX3946275: C2C12

◢ SRX2400133: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400134: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400135: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400136: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400137: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2400138: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580289: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580290: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580291: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580292: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580293: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580294: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580295: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580296: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX2580297: CD4 CD8 double negative cells

◢ SRX7248104: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7248105: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737122: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX8737123: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX140393: CH12

◢ SRX4395348: Embryonic brains

◢ SRX4395357: Embryonic brains

◢ SRX022690: ES cells

◢ SRX022691: ES cells

◢ SRX11237496: ES cells

◢ SRX11237502: ES cells

◢ SRX11237508: ES cells

◢ SRX11237514: ES cells

◢ SRX11237520: ES cells

◢ SRX11237526: ES cells

◢ SRX11237532: ES cells

◢ SRX11237538: ES cells

◢ SRX12265452: ES cells

◢ SRX12265454: ES cells

◢ SRX1338522: ES cells

◢ SRX1338523: ES cells

◢ SRX1688261: ES cells

◢ SRX1688262: ES cells

◢ SRX1688263: ES cells

◢ SRX16989241: ES cells

◢ SRX1704884: ES cells

◢ SRX21250624: ES cells

◢ SRX21250625: ES cells

◢ SRX3197476: ES cells

◢ SRX3197481: ES cells

◢ SRX6691033: ES cells

◢ SRX6691034: ES cells

◢ SRX6691035: ES cells

◢ SRX9326752: ES cells

◢ SRX9326753: ES cells

◢ SRX9326754: ES cells

◢ SRX9326755: ES cells

◢ SRX9326756: ES cells

◢ SRX9326757: ES cells

◢ SRX9326758: ES cells

◢ SRX9326769: ES cells

◢ SRX9326770: ES cells

◢ SRX9326771: ES cells

◢ SRX9326773: ES cells

◢ SRX8820368: G1E-ER4+E2

◢ SRX8820369: G1E-ER4+E2

◢ SRX6903171: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903172: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903176: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903177: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX23076594: Hypothalamus

◢ SRX23076595: Hypothalamus

◢ SRX23076596: Hypothalamus

◢ SRX23076597: Hypothalamus

◢ SRX23076598: Hypothalamus

◢ SRX23076599: Hypothalamus

◢ SRX23076600: Hypothalamus

◢ SRX23076601: Hypothalamus

◢ SRX23076602: Hypothalamus

◢ SRX23076603: Hypothalamus

◢ SRX3088634: Liver

◢ SRX3088635: Liver

◢ SRX120171: MEF

◢ SRX120172: MEF

◢ SRX195359: MEF

◢ SRX195360: MEF

◢ SRX195361: MEF

◢ SRX195362: MEF

◢ SRX195363: MEF

◢ SRX195364: MEF

◢ SRX20980254: MEF

◢ SRX20980255: MEF

◢ SRX20980256: MEF

◢ SRX140386: MEL

◢ SRX8347016: Myogenic progenitors

◢ SRX8347017: Myogenic progenitors

◢ SRX8347018: Myogenic progenitors

◢ SRX8347019: Myogenic progenitors

◢ SRX26175727: NIH/3T3

◢ SRX26175730: NIH/3T3

◢ SRX18809574: Pre-B cells

◢ SRX18809575: Pre-B cells

◢ SRX18809576: Pre-B cells

◢ SRX18809577: Pre-B cells

◢ SRX18809578: Pre-B cells

◢ SRX18809579: Pre-B cells

◢ SRX2254032: Spermatocytes

◢ SRX1306536: T cells

◢ SRX2958713: Unclassified

◢ SRX2958715: Unclassified

◢ SRX2958717: Unclassified

◢ Smc3: STRING
Col1a1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Col14a1 ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Klf1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Tomm5 ↻ ≫
Ngdn ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Pga5 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
4930402F06Rik ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Mertk ↻ ≫
Gpx8 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Cdc20b ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Tafa5 ↻ ≫
Hsd17b6 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Trim65 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Mc5r ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Katnbl1 ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Col6a2 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Fam178b ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Cdc42ep2 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Slc26a8 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Tmem220 ↻ ≫
Trmt10a ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
Tcim ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Nedd4l ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
C1rb ↻ ≫
Kirrel ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Wbp2 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Tlr6 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
Ttll1 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
Becn1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
BC004004 ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Col27a1 ↻ ≫
Ppm1j ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Flvcr2 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Rnf215 ↻ ≫
Eml1 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
Sdc2 ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Tlcd1 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Nck1 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Senp3 ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
T2 ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Elf3 ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Ehd3 ↻ ≫
Gjc2 ↻ ≫
Uqcc2 ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Thbd ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Prnd ↻ ≫
Ppard ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
N4bp2l2 ↻ ≫
Otos ↻ ≫
Cenpx ↻ ≫
Lrrc45 ↻ ≫
Trio ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
Sh3rf3 ↻ ≫
Taf15 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Tpgs1 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Dtx3l ↻ ≫
Diras2 ↻ ≫
Alkbh4 ↻ ≫
Lrwd1 ↻ ≫
Asf1b ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Aadat ↻ ≫
Rfc2 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Pcdhgb8 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Garem1 ↻ ≫
Limk2 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Trmu ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Decr2 ↻ ≫
Tcp11 ↻ ≫
Calr ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Lrrk1 ↻ ≫
Nectin1 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
Flnb ↻ ≫
Rcc1 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Ppp6r2 ↻ ≫
Tsc22d1 ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Abcb8 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Dgkz ↻ ≫
Ago2 ↻ ≫
Prmt3 ↻ ≫
Pcgf1 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Tbc1d4 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Mrps14 ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
Wnk1 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
Ascl5 ↻ ≫
Cacna1s ↻ ≫
Sufu ↻ ≫
Actr1a ↻ ≫
Nemp2 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
Serpinb9 ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Trpm5 ↻ ≫
Depdc1b ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Rpp30 ↻ ≫
Zfp341 ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Rpl18a ↻ ≫
S100a14 ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Faf2 ↻ ≫
Deptor ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Slc35b1 ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Tnni2 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Rrp9 ↻ ≫
Parp3 ↻ ≫
Matn2 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Lyzl6 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Nhej1 ↻ ≫
Tcaf2 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Dnlz ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Apc2 ↻ ≫
Haus7 ↻ ≫
Serpinb6b ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Rtca ↻ ≫
Hrob ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Med18 ↻ ≫
Bpi ↻ ≫
Slc9a4 ↻ ≫
Thbs1 ↻ ≫
Carm1 ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Ess2 ↻ ≫
Ube2l6 ↻ ≫
Farp1 ↻ ≫
Flt3l ↻ ≫
Efnb1 ↻ ≫
Gdf5 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Nectin2 ↻ ≫
Klhdc9 ↻ ≫
Ror1 ↻ ≫
Hoxb5 ↻ ≫
Psmd11 ↻ ≫
Hbq1b ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Casp2 ↻ ≫
Igsf11 ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Lpcat4 ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Tomm40l ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Prpf18 ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Prickle1 ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Mmaa ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Rxfp3 ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
Mettl27 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Map2k1 ↻ ≫
C1ra ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Pdgfra ↻ ≫
Afmid ↻ ≫
Megf8 ↻ ≫
Oma1 ↻ ≫
Slc16a11 ↻ ≫
Entpd6 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Lig4 ↻ ≫
Tcf7l2 ↻ ≫
Apba1 ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Fbxo32 ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Synj2 ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Elob ↻ ≫
Ankrd44 ↻ ≫
Adam5 ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Pdrg1 ↻ ≫
Rtn4rl1 ↻ ≫
Jagn1 ↻ ≫
Cfap97d1 ↻ ≫
Rhoc ↻ ≫
Tbc1d10c ↻ ≫
Ppp1ca ↻ ≫
Dapk2 ↻ ≫
Dipk1a ↻ ≫
Mrpl33 ↻ ≫
Dhx30 ↻ ≫
Mfhas1 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Tctex1d1 ↻ ≫
Lmtk2 ↻ ≫
Trappc3l ↻ ≫
Pmm1 ↻ ≫
Lrrc24 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
C030006K11Rik ↻ ≫
Inka1 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Tmem201 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Cyp11a1 ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
AA467197 ↻ ≫
Twistnb ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Gata3 ↻ ≫
Ciart ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Chd1l ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Prcp ↻ ≫
Ddias ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Upf3a ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Atp6v0d1 ↻ ≫
Pds5b ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Has2 ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Plxna1 ↻ ≫
Asb16 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Mro ↻ ≫
Cdh24 ↻ ≫
Gask1b ↻ ≫
Ep400 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Chrm5 ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Zfp251 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Nob1 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Nol7 ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Adam12 ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Ndufaf6 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Nsg2 ↻ ≫
Mien1 ↻ ≫
Mgst3 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Atp5d ↻ ≫
Dhcr7 ↻ ≫
Sys1 ↻ ≫
Thra ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
App ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Creb3l1 ↻ ≫
Bcl6b ↻ ≫
Tmem106c ↻ ≫
Igfbp3 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Lpin3 ↻ ≫
Fem1a ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Dctpp1 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Gypa ↻ ≫
Pld2 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Ccbe1 ↻ ≫
Car2 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Pex10 ↻ ≫
Lsm2 ↻ ≫
Ppox ↻ ≫
Tmem208 ↻ ≫
Lrrc29 ↻ ≫
Soga1 ↻ ≫
Tonsl ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Sema3d ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Rraga ↻ ≫
Ppm1f ↻ ≫
Pip5k1c ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Tshr ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Sec31b ↻ ≫
Smap2 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
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