ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CTCF

Query protein: CTCF
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9660890 | Central Nervous System
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CTCF's Target genes

◢ CTCF: Average

◢ SRX11499361: 0-14h embryos

◢ SRX11499362: 0-14h embryos

◢ SRX11499363: 0-14h embryos

◢ SRX11499364: 0-14h embryos

◢ SRX11499365: 0-14h embryos

◢ SRX11499366: 0-14h embryos

◢ SRX11499367: 0-14h embryos

◢ SRX11499368: 0-14h embryos

◢ SRX287743: 14-16h embryos

◢ SRX287744: 14-16h embryos

◢ SRX474576: 5-13h embryos

◢ SRX474577: 5-13h embryos

◢ SRX474578: 5-13h embryos

◢ SRX671941: 5-13h embryos

◢ SRX7889132: Central Nervous System

◢ SRX7889133: Central Nervous System

◢ SRX7889134: Central Nervous System

◢ SRX7889135: Central Nervous System

◢ SRX7889142: Central Nervous System

◢ SRX9660889: Central Nervous System

◣ SRX9660890: Central Nervous System

◢ SRX14474253: Cultured cell lines

◢ SRX14474261: Cultured cell lines

◢ SRX14474277: Cultured cell lines

◢ SRX14474281: Cultured cell lines

◢ SRX2010897: Embryos

◢ SRX6780074: Embryos

◢ SRX645427: Eye-antennal disc

◢ SRX085404: Kc167

◢ SRX085405: Kc167

◢ SRX085406: Kc167

◢ SRX100250: Kc167

◢ SRX100251: Kc167

◢ SRX1021223: Kc167

◢ SRX252226: Kc167

◢ SRX749039: Kc167

◢ SRX749040: Kc167

◢ SRX749041: Kc167

◢ SRX016158: S2

◢ SRX016160: S2

◢ SRX191913: S2

◢ SRX191914: S2

◢ SRX2638363: S2

◢ SRX2638364: S2

◢ SRX027388: White prepupae

◢ CTCF: STRING
Pkcdelta ↻ ≫
slbo ↻ ≫
bs ↻ ≫
Jafrac1 ↻ ≫
Cpr76Ba ↻ ≫
Cpr76Bc ↻ ≫
Cpr76Bb ↻ ≫
unc-5 ↻ ≫
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CG1077 ↻ ≫
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Cyp311a1 ↻ ≫
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N ↻ ≫
Rlip ↻ ≫
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l(1)sc ↻ ≫
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stl ↻ ≫
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Act88F ↻ ≫
Fancm ↻ ≫
prage ↻ ≫
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eIF3d1 ↻ ≫
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GILT2 ↻ ≫
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CG15126 ↻ ≫
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Eh ↻ ≫
SLO2 ↻ ≫
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CG42813 ↻ ≫
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Nc73EF ↻ ≫
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CG2750 ↻ ≫
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Cpr51A ↻ ≫
CG1354 ↻ ≫
CARPB ↻ ≫
Ptpmeg2 ↻ ≫
CG3106 ↻ ≫
Gr98d ↻ ≫
Gr98c ↻ ≫
Gr98b ↻ ≫
lectin-46Cb ↻ ≫
CG1648 ↻ ≫
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scrib ↻ ≫
CG10041 ↻ ≫
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SP1173 ↻ ≫
DIP-iota ↻ ≫
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Ubr1 ↻ ≫
beat-IIIc ↻ ≫
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Dsk ↻ ≫
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Paip2 ↻ ≫
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Syn2 ↻ ≫
CG9171 ↻ ≫
obst-E ↻ ≫
stet ↻ ≫
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Myd88 ↻ ≫
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RpL37a ↻ ≫
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Spc105R ↻ ≫
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dpr16 ↻ ≫
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PK1-R ↻ ≫
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GlyP ↻ ≫
CG4259 ↻ ≫
Vsx2 ↻ ≫
Ir67b ↻ ≫
Pde1c ↻ ≫
CycY ↻ ≫
CG10222 ↻ ≫
flr ↻ ≫
CG1632 ↻ ≫
ND-75 ↻ ≫
ec ↻ ≫
Svil ↻ ≫
CG43980 ↻ ≫
Mef2 ↻ ≫
stc ↻ ≫
CG15269 ↻ ≫
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Hk ↻ ≫
Tsp68C ↻ ≫
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a ↻ ≫
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Mp ↻ ≫
bin ↻ ≫
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nxf4 ↻ ≫
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Cyp6a22 ↻ ≫
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CheB93a ↻ ≫
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Ugt303B3 ↻ ≫
Rubicon ↻ ≫
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Sfp84E ↻ ≫
Os-C ↻ ≫
CD98hc ↻ ≫
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CG14891 ↻ ≫
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CG5213 ↻ ≫
Sdc ↻ ≫
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CG14881 ↻ ≫
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Fhos ↻ ≫
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Vm32E ↻ ≫
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sbr ↻ ≫
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Poc1 ↻ ≫
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snu ↻ ≫
Sid ↻ ≫
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east ↻ ≫
PIG-K ↻ ≫
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cm ↻ ≫
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elgi ↻ ≫
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dpr6 ↻ ≫
Pura ↻ ≫
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Raf ↻ ≫
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Sh ↻ ≫
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yellow-d ↻ ≫
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Thor ↻ ≫
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Spindly ↻ ≫
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Plp ↻ ≫
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mthl2 ↻ ≫
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ppk7 ↻ ≫
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Pez ↻ ≫
Cpr ↻ ≫
CG42402 ↻ ≫
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ham ↻ ≫
ind ↻ ≫
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CG33178 ↻ ≫
CG33177 ↻ ≫
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mthl14 ↻ ≫
E(bx) ↻ ≫
CG8728 ↻ ≫
CG34430 ↻ ≫
CG30380 ↻ ≫
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l(3)mbn ↻ ≫
FMRFa ↻ ≫
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Mes2 ↻ ≫
CG14990 ↻ ≫
Gad1 ↻ ≫
CG14989 ↻ ≫
Den1 ↻ ≫
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CG34021 ↻ ≫
Eglp2 ↻ ≫
IM18 ↻ ≫
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CG42560 ↻ ≫
CG42559 ↻ ≫
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Smyd5 ↻ ≫
Oga ↻ ≫
Nelf-A ↻ ≫
CG3337 ↻ ≫
apt ↻ ≫
RhoGEF64C ↻ ≫
CG7514 ↻ ≫
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axo ↻ ≫
Or67c ↻ ≫
stg ↻ ≫
SP1029 ↻ ≫
CG45544 ↻ ≫
CG33557 ↻ ≫
CG2990 ↻ ≫
CG3358 ↻ ≫
CHES-1-like ↻ ≫
CG15478 ↻ ≫
acj6 ↻ ≫
CG8306 ↻ ≫
CG5089 ↻ ≫
Loxl1 ↻ ≫
CG11334 ↻ ≫
CG11333 ↻ ≫
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Patj ↻ ≫
dlt ↻ ≫
alpha-Spec ↻ ≫
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CG12020 ↻ ≫
mus304 ↻ ≫
RpIIIC53 ↻ ≫
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Rrp46 ↻ ≫
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Bub1 ↻ ≫
Bsg25D ↻ ≫
Edg84A ↻ ≫
Ccp84Ag ↻ ≫
lab ↻ ≫
shot ↻ ≫
DJ-1alpha ↻ ≫
Prp31 ↻ ≫
Msh6 ↻ ≫
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CG6878 ↻ ≫
Fs ↻ ≫
scb ↻ ≫
Toll-7 ↻ ≫
Npc2b ↻ ≫
CG15040 ↻ ≫
Wnt4 ↻ ≫
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CG5504 ↻ ≫
Sesn ↻ ≫
CG46429 ↻ ≫
Alg3 ↻ ≫
RpS28a ↻ ≫
Mgat2 ↻ ≫
Axn ↻ ≫
otp ↻ ≫
CAH15 ↻ ≫
Eaat1 ↻ ≫
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Ptp61F ↻ ≫
312 ↻ ≫
Spn75F ↻ ≫
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dnt ↻ ≫
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vas ↻ ≫
solo ↻ ≫
TfIIS ↻ ≫
ck ↻ ≫
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can ↻ ≫
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Nlg3 ↻ ≫
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CG10357 ↻ ≫
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Nhe3 ↻ ≫
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Lap1 ↻ ≫
Oseg2 ↻ ≫
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trv ↻ ≫
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pk ↻ ≫
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CG33460 ↻ ≫
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Tor ↻ ≫
Pdp1 ↻ ≫
tun ↻ ≫
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tow ↻ ≫
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CG15535 ↻ ≫
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CG10947 ↻ ≫
Arpc2 ↻ ≫
CheA56a ↻ ≫
CG30122 ↻ ≫
kek5 ↻ ≫
nAChRalpha7 ↻ ≫
ome ↻ ≫
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