ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CTCF

Query protein: CTCF
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9660889 | Central Nervous System
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CTCF's Target genes

◢ CTCF: Average

◢ SRX11499361: 0-14h embryos

◢ SRX11499362: 0-14h embryos

◢ SRX11499363: 0-14h embryos

◢ SRX11499364: 0-14h embryos

◢ SRX11499365: 0-14h embryos

◢ SRX11499366: 0-14h embryos

◢ SRX11499367: 0-14h embryos

◢ SRX11499368: 0-14h embryos

◢ SRX287743: 14-16h embryos

◢ SRX287744: 14-16h embryos

◢ SRX474576: 5-13h embryos

◢ SRX474577: 5-13h embryos

◢ SRX474578: 5-13h embryos

◢ SRX671941: 5-13h embryos

◢ SRX7889132: Central Nervous System

◢ SRX7889133: Central Nervous System

◢ SRX7889134: Central Nervous System

◢ SRX7889135: Central Nervous System

◢ SRX7889142: Central Nervous System

◣ SRX9660889: Central Nervous System

◢ SRX9660890: Central Nervous System

◢ SRX14474253: Cultured cell lines

◢ SRX14474261: Cultured cell lines

◢ SRX14474277: Cultured cell lines

◢ SRX14474281: Cultured cell lines

◢ SRX2010897: Embryos

◢ SRX6780074: Embryos

◢ SRX645427: Eye-antennal disc

◢ SRX085404: Kc167

◢ SRX085405: Kc167

◢ SRX085406: Kc167

◢ SRX100250: Kc167

◢ SRX100251: Kc167

◢ SRX1021223: Kc167

◢ SRX252226: Kc167

◢ SRX749039: Kc167

◢ SRX749040: Kc167

◢ SRX749041: Kc167

◢ SRX016158: S2

◢ SRX016160: S2

◢ SRX191913: S2

◢ SRX191914: S2

◢ SRX2638363: S2

◢ SRX2638364: S2

◢ SRX027388: White prepupae

◢ CTCF: STRING
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Pkcdelta ↻ ≫
slbo ↻ ≫
bs ↻ ≫
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Grik ↻ ≫
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N ↻ ≫
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Ir67b ↻ ≫
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fus ↻ ≫
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Mp ↻ ≫
bin ↻ ≫
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flr ↻ ≫
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Cyp6a22 ↻ ≫
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a ↻ ≫
gom ↻ ≫
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ema ↻ ≫
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Sh ↻ ≫
ec ↻ ≫
fd3F ↻ ≫
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fz4 ↻ ≫
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CG8117 ↻ ≫
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sick ↻ ≫
sbr ↻ ≫
Imp ↻ ≫
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east ↻ ≫
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snu ↻ ≫
Sid ↻ ≫
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Gr98c ↻ ≫
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polo ↻ ≫
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garz ↻ ≫
CG8841 ↻ ≫
ana3 ↻ ≫
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RpS2 ↻ ≫
Bka ↻ ≫
nAChRalpha6 ↻ ≫
Fkbp59 ↻ ≫
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CG34183 ↻ ≫
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CG46270 ↻ ≫
kra ↻ ≫
asl ↻ ≫
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Rga ↻ ≫
Atu ↻ ≫
viaf ↻ ≫
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CG6928 ↻ ≫
abd-A ↻ ≫
nrv3 ↻ ≫
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Lmpt ↻ ≫
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CD98hc ↻ ≫
Sfp84E ↻ ≫
Os-C ↻ ≫
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dpr20 ↻ ≫
Dci ↻ ≫
GABA-B-R3 ↻ ≫
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dila ↻ ≫
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ScpX ↻ ≫
CG17597 ↻ ≫
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mRpL14 ↻ ≫
Raf ↻ ≫
Ilp6 ↻ ≫
su(w[a]) ↻ ≫
TfIIA-S-2 ↻ ≫
CG14631 ↻ ≫
Plp ↻ ≫
Or71a ↻ ≫
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Vsx2 ↻ ≫
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Ebp ↻ ≫
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shot ↻ ≫
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glu ↻ ≫
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Aprt ↻ ≫
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axo ↻ ≫
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scpr-A ↻ ≫
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drm ↻ ≫
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IFT52 ↻ ≫
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wcy ↻ ≫
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obe ↻ ≫
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Rh6 ↻ ≫
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mof ↻ ≫
Usp30 ↻ ≫
CG16721 ↻ ≫
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