ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CTCF

Query protein: CTCF
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX9660890 | Central Nervous System
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CTCF's Target genes

◢ CTCF: Average

◢ SRX11499361: 0-14h embryos

◢ SRX11499362: 0-14h embryos

◢ SRX11499363: 0-14h embryos

◢ SRX11499364: 0-14h embryos

◢ SRX11499365: 0-14h embryos

◢ SRX11499366: 0-14h embryos

◢ SRX11499367: 0-14h embryos

◢ SRX11499368: 0-14h embryos

◢ SRX287743: 14-16h embryos

◢ SRX287744: 14-16h embryos

◢ SRX474576: 5-13h embryos

◢ SRX474577: 5-13h embryos

◢ SRX474578: 5-13h embryos

◢ SRX671941: 5-13h embryos

◢ SRX7889132: Central Nervous System

◢ SRX7889133: Central Nervous System

◢ SRX7889134: Central Nervous System

◢ SRX7889135: Central Nervous System

◢ SRX7889142: Central Nervous System

◢ SRX9660889: Central Nervous System

◣ SRX9660890: Central Nervous System

◢ SRX14474253: Cultured cell lines

◢ SRX14474261: Cultured cell lines

◢ SRX14474277: Cultured cell lines

◢ SRX14474281: Cultured cell lines

◢ SRX2010897: Embryos

◢ SRX6780074: Embryos

◢ SRX645427: Eye-antennal disc

◢ SRX085404: Kc167

◢ SRX085405: Kc167

◢ SRX085406: Kc167

◢ SRX100250: Kc167

◢ SRX100251: Kc167

◢ SRX1021223: Kc167

◢ SRX252226: Kc167

◢ SRX749039: Kc167

◢ SRX749040: Kc167

◢ SRX749041: Kc167

◢ SRX016158: S2

◢ SRX016160: S2

◢ SRX191913: S2

◢ SRX191914: S2

◢ SRX2638363: S2

◢ SRX2638364: S2

◢ SRX027388: White prepupae

◢ CTCF: STRING
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Pkcdelta ↻ ≫
slbo ↻ ≫
bs ↻ ≫
RpS15Aa ↻ ≫
Jafrac1 ↻ ≫
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CG15747 ↻ ≫
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Cyp311a1 ↻ ≫
zfh1 ↻ ≫
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flz ↻ ≫
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gt ↻ ≫
CG32797 ↻ ≫
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Timp ↻ ≫
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N ↻ ≫
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Rbfox1 ↻ ≫
TyrRII ↻ ≫
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Atg8b ↻ ≫
l(1)sc ↻ ≫
TotX ↻ ≫
Grik ↻ ≫
hdly ↻ ≫
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sls ↻ ≫
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stl ↻ ≫
blw ↻ ≫
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CG42260 ↻ ≫
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CG3335 ↻ ≫
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loj ↻ ≫
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Ets65A ↻ ≫
prage ↻ ≫
Adar ↻ ≫
GILT3 ↻ ≫
GILT2 ↻ ≫
SPE ↻ ≫
eIF3d1 ↻ ≫
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CG16710 ↻ ≫
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Spn ↻ ≫
CG32295 ↻ ≫
cher ↻ ≫
ftz-f1 ↻ ≫
Obp56c ↻ ≫
Obp56b ↻ ≫
Obp56a ↻ ≫
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CG15126 ↻ ≫
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Oseg2 ↻ ≫
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Shmt ↻ ≫
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CG12236 ↻ ≫
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Act5C ↻ ≫
CG45084 ↻ ≫
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beat-IIIa ↻ ≫
CG31784 ↻ ≫
larp ↻ ≫
Or98b ↻ ≫
Moca-cyp ↻ ≫
Gfat2 ↻ ≫
Eh ↻ ≫
CG14331 ↻ ≫
CG14330 ↻ ≫
SLO2 ↻ ≫
Mipp1 ↻ ≫
CG43206 ↻ ≫
CG4229 ↻ ≫
CG31064 ↻ ≫
CG42814 ↻ ≫
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CG42813 ↻ ≫
Nc73EF ↻ ≫
Cpr73D ↻ ≫
CG2750 ↻ ≫
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Asx ↻ ≫
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Cpr51A ↻ ≫
CARPB ↻ ≫
CG1354 ↻ ≫
Ptpmeg2 ↻ ≫
CG3106 ↻ ≫
Gr98d ↻ ≫
Gr98c ↻ ≫
Gr98b ↻ ≫
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lectin-46Ca ↻ ≫
CG34033 ↻ ≫
CG1648 ↻ ≫
CG1688 ↻ ≫
CG31275 ↻ ≫
scrib ↻ ≫
MBD-R2 ↻ ≫
CG4115 ↻ ≫
CG10041 ↻ ≫
CG10038 ↻ ≫
CG44956 ↻ ≫
CG14186 ↻ ≫
CG14185 ↻ ≫
sNPF-R ↻ ≫
hwt ↻ ≫
CG9344 ↻ ≫
CG9313 ↻ ≫
CG34115 ↻ ≫
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CG15650 ↻ ≫
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SP1173 ↻ ≫
DIP-iota ↻ ≫
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beat-IIIc ↻ ≫
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CG14759 ↻ ≫
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tzn ↻ ≫
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Six4 ↻ ≫
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CG12590 ↻ ≫
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PK1-R ↻ ≫
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CG5149 ↻ ≫
Tak1 ↻ ≫
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Ir67b ↻ ≫
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crol ↻ ≫
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sens ↻ ≫
flr ↻ ≫
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sni ↻ ≫
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ec ↻ ≫
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CG43980 ↻ ≫
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fus ↻ ≫
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CG8750 ↻ ≫
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a ↻ ≫
gom ↻ ≫
CG11269 ↻ ≫
Mp ↻ ≫
bin ↻ ≫
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Cpr30B ↻ ≫
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CG13114 ↻ ≫
CG13113 ↻ ≫
dila ↻ ≫
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lms ↻ ≫
CG13430 ↻ ≫
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Obp57d ↻ ≫
Cpr57A ↻ ≫
Obp57e ↻ ≫
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Nepl16 ↻ ≫
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CG45095 ↻ ≫
ovo ↻ ≫
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CG31510 ↻ ≫
CG43693 ↻ ≫
nxf4 ↻ ≫
CG43290 ↻ ≫
CG31496 ↻ ≫
insv ↻ ≫
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ND-B17.2 ↻ ≫
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Drp1 ↻ ≫
CG15394 ↻ ≫
Pcf11 ↻ ≫
Cyp6a23 ↻ ≫
Cyp6a22 ↻ ≫
Cyp6a19 ↻ ≫
Cyp6a17 ↻ ≫
Cyp6a9 ↻ ≫
U3-55K ↻ ≫
Rgk3 ↻ ≫
ASPP ↻ ≫
Cyp12e1 ↻ ≫
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fz4 ↻ ≫
CheB93b ↻ ≫
CheB93a ↻ ≫
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Ugt303B2 ↻ ≫
Ugt303B1 ↻ ≫
CG10175 ↻ ≫
Rubicon ↻ ≫
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DIP-eta ↻ ≫
Cyp6a16 ↻ ≫
CD98hc ↻ ≫
Sfp84E ↻ ≫
Os-C ↻ ≫
CG15429 ↻ ≫
Atet ↻ ≫
GABA-B-R3 ↻ ≫
Eaat2 ↻ ≫
Scp2 ↻ ≫
CG14903 ↻ ≫
CG14891 ↻ ≫
CG15919 ↻ ≫
CG15615 ↻ ≫
obe ↻ ≫
Trissin ↻ ≫
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Rh6 ↻ ≫
Sdc ↻ ≫
mRpS33 ↻ ≫
ema ↻ ≫
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CG14881 ↻ ≫
CG31279 ↻ ≫
ND-15 ↻ ≫
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CG3164 ↻ ≫
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Prm ↻ ≫
Fhos ↻ ≫
CG6576 ↻ ≫
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Vm32E ↻ ≫
CG4788 ↻ ≫
abd-A ↻ ≫
CG9220 ↻ ≫
Alp11 ↻ ≫
CG42327 ↻ ≫
CG14715 ↻ ≫
TfAP-2 ↻ ≫
Pde8 ↻ ≫
retn ↻ ≫
scramb1 ↻ ≫
CG8065 ↻ ≫
CG32055 ↻ ≫
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dpr20 ↻ ≫
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CG42784 ↻ ≫
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nau ↻ ≫
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glu ↻ ≫
LSm7 ↻ ≫
ChLD3 ↻ ≫
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sbr ↻ ≫
Imp ↻ ≫
CG15210 ↻ ≫
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Socs36E ↻ ≫
JMJD4 ↻ ≫
CG5783 ↻ ≫
CG17681 ↻ ≫
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su(w[a]) ↻ ≫
TfIIA-S-2 ↻ ≫
CG14631 ↻ ≫
Poc1 ↻ ≫
ImpL1 ↻ ≫
CG14110 ↻ ≫
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Cp18 ↻ ≫
Cp15 ↻ ≫
CG6511 ↻ ≫
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snu ↻ ≫
Sid ↻ ≫
CG33346 ↻ ≫
ScpX ↻ ≫
CG17597 ↻ ≫
CG10600 ↻ ≫
CG33120 ↻ ≫
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Gp150 ↻ ≫
tapas ↻ ≫
MED8 ↻ ≫
CG8929 ↻ ≫
Picot ↻ ≫
CG34458 ↻ ≫
CG34457 ↻ ≫
Tmhs ↻ ≫
CG13937 ↻ ≫
Aprt ↻ ≫
dsb ↻ ≫
mtDNA-helicase ↻ ≫
RpS2 ↻ ≫
Bka ↻ ≫
nAChRalpha6 ↻ ≫
Fkbp59 ↻ ≫
CG4537 ↻ ≫
CG34183 ↻ ≫
CG5890 ↻ ≫
CG5886 ↻ ≫
CG14545 ↻ ≫
RagA-B ↻ ≫
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CAHbeta ↻ ≫
scpr-B ↻ ≫
scpr-A ↻ ≫
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Arfip ↻ ≫
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CG1785 ↻ ≫
l(1)G0020 ↻ ≫
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viaf ↻ ≫
Pop2 ↻ ≫
Grip163 ↻ ≫
CG6928 ↻ ≫
sick ↻ ≫
CG10481 ↻ ≫
CG17549 ↻ ≫
fon ↻ ≫
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Lmpt ↻ ≫
east ↻ ≫
PIG-K ↻ ≫
Galphaq ↻ ≫
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CG9395 ↻ ≫
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CG3032 ↻ ≫
cm ↻ ≫
CG42308 ↻ ≫
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Usp47 ↻ ≫
DnaJ-1 ↻ ≫
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Nepl19 ↻ ≫
Nepl18 ↻ ≫
Nepl17 ↻ ≫
Nepl20 ↻ ≫
IFT52 ↻ ≫
Ent2 ↻ ≫
COX5BL ↻ ≫
COX5B ↻ ≫
CG9596 ↻ ≫
CG13766 ↻ ≫
CG17032 ↻ ≫
elgi ↻ ≫
Pka-C3 ↻ ≫
GXIVsPLA2 ↻ ≫
vnc ↻ ≫
dpr6 ↻ ≫
Dronc ↻ ≫
CG6685 ↻ ≫
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Pura ↻ ≫
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mRpL14 ↻ ≫
Raf ↻ ≫
Ilp6 ↻ ≫
CG14160 ↻ ≫
CG32054 ↻ ≫
CG32053 ↻ ≫
Socs16D ↻ ≫
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Sh ↻ ≫
nrv3 ↻ ≫
CG8665 ↻ ≫
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sra ↻ ≫
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Bin1 ↻ ≫
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Gr39b ↻ ≫
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Spn28Da ↻ ≫
SmE ↻ ≫
CG7102 ↻ ≫
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yellow-d2 ↻ ≫
yellow-d ↻ ≫
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Golgin245 ↻ ≫
Ice1 ↻ ≫
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Gsc ↻ ≫
CG13689 ↻ ≫
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CG12206 ↻ ≫
CG10804 ↻ ≫
CG10803 ↻ ≫
CG10802 ↻ ≫
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Kua ↻ ≫
CG13970 ↻ ≫
kra ↻ ≫
asl ↻ ≫
SecS ↻ ≫
Rga ↻ ≫
Atu ↻ ≫
Thor ↻ ≫
Pgant4 ↻ ≫
cmpy ↻ ≫
CG34260 ↻ ≫
drm ↻ ≫
Sr-CIV ↻ ≫
Spindly ↻ ≫
IFT57 ↻ ≫
CG8852 ↻ ≫
CG8851 ↻ ≫
Plp ↻ ≫
Or71a ↻ ≫
Sytbeta ↻ ≫
Got1 ↻ ≫
CysRS ↻ ≫
CG30094 ↻ ≫
GCS2alpha ↻ ≫
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CG3386 ↻ ≫
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mthl2 ↻ ≫
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Eaf6 ↻ ≫
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EbpII ↻ ≫
Ebp ↻ ≫
CG9497 ↻ ≫
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ppk7 ↻ ≫
ppk14 ↻ ≫
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pan ↻ ≫
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polo ↻ ≫
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frj ↻ ≫
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Pez ↻ ≫
Cpr ↻ ≫
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lectin-28C ↻ ≫
TwdlE ↻ ≫
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sns ↻ ≫
ham ↻ ≫
ind ↻ ≫
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