ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CTCF

Query protein: CTCF
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX749039 | Kc167
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CTCF's Target genes

◢ CTCF: Average

◢ SRX11499361: 0-14h embryos

◢ SRX11499362: 0-14h embryos

◢ SRX11499363: 0-14h embryos

◢ SRX11499364: 0-14h embryos

◢ SRX11499365: 0-14h embryos

◢ SRX11499366: 0-14h embryos

◢ SRX11499367: 0-14h embryos

◢ SRX11499368: 0-14h embryos

◢ SRX287743: 14-16h embryos

◢ SRX287744: 14-16h embryos

◢ SRX474576: 5-13h embryos

◢ SRX474577: 5-13h embryos

◢ SRX474578: 5-13h embryos

◢ SRX671941: 5-13h embryos

◢ SRX7889132: Central Nervous System

◢ SRX7889133: Central Nervous System

◢ SRX7889134: Central Nervous System

◢ SRX7889135: Central Nervous System

◢ SRX7889142: Central Nervous System

◢ SRX9660889: Central Nervous System

◢ SRX9660890: Central Nervous System

◢ SRX14474253: Cultured cell lines

◢ SRX14474261: Cultured cell lines

◢ SRX14474277: Cultured cell lines

◢ SRX14474281: Cultured cell lines

◢ SRX2010897: Embryos

◢ SRX6780074: Embryos

◢ SRX645427: Eye-antennal discs

◢ SRX085404: Kc167

◢ SRX085405: Kc167

◢ SRX085406: Kc167

◢ SRX100250: Kc167

◢ SRX100251: Kc167

◢ SRX1021223: Kc167

◢ SRX252226: Kc167

◣ SRX749039: Kc167

◢ SRX749040: Kc167

◢ SRX749041: Kc167

◢ SRX016158: S2

◢ SRX016160: S2

◢ SRX191913: S2

◢ SRX191914: S2

◢ SRX2638363: S2

◢ SRX2638364: S2

◢ SRX027388: White prepupae

◢ CTCF: STRING
CadN ↻ ≫
beat-IIIc ↻ ≫
Su(var)2-HP2 ↻ ≫
Sec61beta ↻ ≫
Had2 ↻ ≫
CG12863 ↻ ≫
Indy ↻ ≫
siz ↻ ≫
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CG5561 ↻ ≫
CG5556 ↻ ≫
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SNF4Agamma ↻ ≫
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Wnt4 ↻ ≫
Nc73EF ↻ ≫
Cpr73D ↻ ≫
for ↻ ≫
Drgx ↻ ≫
CG31960 ↻ ≫
bowl ↻ ≫
bark ↻ ≫
CG46301 ↻ ≫
Tlk ↻ ≫
Rala ↻ ≫
Abd-B ↻ ≫
Prm ↻ ≫
Fhos ↻ ≫
CG6576 ↻ ≫
CG13306 ↻ ≫
mthl14 ↻ ≫
E(bx) ↻ ≫
CG3556 ↻ ≫
Rbfox1 ↻ ≫
unc-5 ↻ ≫
Hr51 ↻ ≫
CG9171 ↻ ≫
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CG31275 ↻ ≫
TwdlE ↻ ≫
lectin-28C ↻ ≫
CG14535 ↻ ≫
CHES-1-like ↻ ≫
CG15478 ↻ ≫
CG5906 ↻ ≫
Sprn ↻ ≫
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CG43693 ↻ ≫
TfAP-2 ↻ ≫
CG7888 ↻ ≫
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CG8117 ↻ ≫
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tna ↻ ≫
VhaM9.7-d ↻ ≫
Actn3 ↻ ≫
CG13280 ↻ ≫
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mdy ↻ ≫
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RpS21 ↻ ≫
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prage ↻ ≫
Adar ↻ ≫
sick ↻ ≫
CG10481 ↻ ≫
cm ↻ ≫
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CG32736 ↻ ≫
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Neu2 ↻ ≫
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croc ↻ ≫
Tsp68C ↻ ≫
Hml ↻ ≫
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CG8750 ↻ ≫
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CG31698 ↻ ≫
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Ubr1 ↻ ≫
wts ↻ ≫
dj-1beta ↻ ≫
cindr ↻ ≫
hwt ↻ ≫
vir-1 ↻ ≫
SC35 ↻ ≫
eRF3 ↻ ≫
CG6405 ↻ ≫
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CG5435 ↻ ≫
caps ↻ ≫
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scrib ↻ ≫
plum ↻ ≫
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Usp30 ↻ ≫
mof ↻ ≫
CG16721 ↻ ≫
snu ↻ ≫
Sid ↻ ≫
CG33346 ↻ ≫
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Lasp ↻ ≫
Dab ↻ ≫
CG9692 ↻ ≫
CG43954 ↻ ≫
CG15373 ↻ ≫
CG42700 ↻ ≫
Cam ↻ ≫
CG44439 ↻ ≫
CG30369 ↻ ≫
CG2291 ↻ ≫
CG14760 ↻ ≫
CG14759 ↻ ≫
CG14082 ↻ ≫
Spn75F ↻ ≫
DCX-EMAP ↻ ≫
RpIIIC53 ↻ ≫
mus304 ↻ ≫
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CG7341 ↻ ≫
CG32195 ↻ ≫
CG13698 ↻ ≫
CG42853 ↻ ≫
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CG31787 ↻ ≫
Sfp36F ↻ ≫
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TwdlZ ↻ ≫
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zip ↻ ≫
uzip ↻ ≫
shot ↻ ≫
DJ-1alpha ↻ ≫
Rpn12R ↻ ≫
ind ↻ ≫
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CG12310 ↻ ≫
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Rx ↻ ≫
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CG15212 ↻ ≫
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CG5860 ↻ ≫
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Syn2 ↻ ≫
Npc2b ↻ ≫
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tbrd-1 ↻ ≫
Pli ↻ ≫
PK1-R ↻ ≫
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Or67d ↻ ≫
can ↻ ≫
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Spag1 ↻ ≫
Tsp97E ↻ ≫
Gr97a ↻ ≫
Tak1 ↻ ≫
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viaf ↻ ≫
Pop2 ↻ ≫
Grip163 ↻ ≫
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bcd ↻ ≫
Ama ↻ ≫
zen ↻ ≫
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Diap1 ↻ ≫
Svil ↻ ≫
CG16762 ↻ ≫
dco ↻ ≫
Chchd3 ↻ ≫
Sox100B ↻ ≫
Mef2 ↻ ≫
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CG13896 ↻ ≫
CG13895 ↻ ≫
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CG43290 ↻ ≫
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Thor ↻ ≫
Pgant4 ↻ ≫
Pif1 ↻ ≫
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msl-2 ↻ ≫
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CysRS ↻ ≫
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Mp ↻ ≫
raskol ↻ ≫
nrv2 ↻ ≫
CG43610 ↻ ≫
CG17377 ↻ ≫
CG17376 ↻ ≫
CG17375 ↻ ≫
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fal ↻ ≫
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ema ↻ ≫
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pont ↻ ≫
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Spn ↻ ≫
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phyl ↻ ≫
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dnc ↻ ≫
gol ↻ ≫
Myd88 ↻ ≫
lace ↻ ≫
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Ndae1 ↻ ≫
CG31909 ↻ ≫
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ZnT77C ↻ ≫
ND-39 ↻ ≫
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CG32425 ↻ ≫
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fl(2)d ↻ ≫
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CG6347 ↻ ≫
CG6337 ↻ ≫
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Sr-CII ↻ ≫
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wcy ↻ ≫
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COX5B ↻ ≫
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CG13766 ↻ ≫
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IP3K2 ↻ ≫
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stl ↻ ≫
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nol ↻ ≫
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His2B:CG33888 ↻ ≫
His2B:CG33886 ↻ ≫
His2B:CG33884 ↻ ≫
His2B:CG33880 ↻ ≫
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CG10163 ↻ ≫
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dila ↻ ≫
CG30001 ↻ ≫
Rubicon ↻ ≫
CAH3 ↻ ≫
N ↻ ≫
kirre ↻ ≫
Lk ↻ ≫
CG34039 ↻ ≫
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Unc-115b ↻ ≫
eca ↻ ≫
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p24-2 ↻ ≫
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Imp ↻ ≫
sbr ↻ ≫
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Hers ↻ ≫
amn ↻ ≫
Sox21a ↻ ≫
Men ↻ ≫
Tpst ↻ ≫
CG46311 ↻ ≫
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nej ↻ ≫
btd ↻ ≫
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scpr-B ↻ ≫
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tub ↻ ≫
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lost ↻ ≫
Pde1c ↻ ≫
Shmt ↻ ≫
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Act5C ↻ ≫
CycY ↻ ≫
crol ↻ ≫
Pax ↻ ≫
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Alp12 ↻ ≫
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lectin-37Db ↻ ≫
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RtcB ↻ ≫
Rab9 ↻ ≫
trio ↻ ≫
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galla-2 ↻ ≫
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Blos4 ↻ ≫
cmpy ↻ ≫
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bt ↻ ≫
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wdp ↻ ≫
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InR ↻ ≫
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cort ↻ ≫
Tsp ↻ ≫
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Raf ↻ ≫
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qvr ↻ ≫
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CG15317 ↻ ≫
stg ↻ ≫
SP1029 ↻ ≫
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CG31445 ↻ ≫
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Kua ↻ ≫
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sbm ↻ ≫
PDZ-GEF ↻ ≫
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prd ↻ ≫
Cyp12d1-d ↻ ≫
BBS4 ↻ ≫
CG13229 ↻ ≫
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pkaap ↻ ≫
Cyp303a1 ↻ ≫
crp ↻ ≫
CG17329 ↻ ≫
CG13258 ↻ ≫
Vsx2 ↻ ≫
CG12782 ↻ ≫
PCB ↻ ≫
Ntmt ↻ ≫
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CG30010 ↻ ≫
Lime ↻ ≫
CG12744 ↻ ≫
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GILT3 ↻ ≫
GILT2 ↻ ≫
SPE ↻ ≫
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Aps ↻ ≫
CheB93b ↻ ≫
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vkg ↻ ≫
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cpo ↻ ≫
Rim ↻ ≫
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Pez ↻ ≫
Cpr ↻ ≫
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sgg ↻ ≫
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CecC ↻ ≫
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Anp ↻ ≫
velo ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
CG8549 ↻ ≫
dikar ↻ ≫
Rsph3 ↻ ≫
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