ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for RARA

Query protein: RARA
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX3584310 | iPSC derived chondrocytes
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
RARA's Target genes

◢ RARA: Average

◢ SRX2748853: Adenoid cystic carcinoma

◢ SRX2748855: Adenoid cystic carcinoma

◢ SRX10442515: BE(2)-C

◢ SRX8814860: BE(2)-C

◢ SRX2635935: Hep G2

◢ SRX2635936: Hep G2

◢ SRX25244558: hESC derived endodermal cells

◢ SRX25244559: hESC derived endodermal cells

◢ SRX25244560: hESC derived endodermal cells

◢ SRX25244561: hESC derived endodermal cells

◢ SRX21236745: IMR-32

◢ SRX21236746: IMR-32

◢ SRX21236747: IMR-32

◢ SRX21236748: IMR-32

◢ SRX3584302: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584303: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584304: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584305: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584306: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584307: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584308: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584309: iPSC derived chondrocytes

◣ SRX3584310: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584311: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584312: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584313: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX6039037: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX6039038: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX6039039: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX6039040: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX6039041: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX6039042: iPSC derived chondrocytes

◢ SRX3584300: iPS cells

◢ SRX3584301: iPS cells

◢ SRX19662659: Ishikawa

◢ SRX19662660: Ishikawa

◢ SRX4671297: NAMEC8

◢ SRX4671298: NAMEC8

◢ SRX4671299: NAMEC8

◢ SRX014752: NB-4

◢ SRX014770: NB-4

◢ SRX17639399: NB-4

◢ SRX17639400: NB-4

◢ SRX17639401: NB-4

◢ SRX17639402: NB-4

◢ SRX8814876: Neuroblastoma

◢ SRX9607665: NTERA-2

◢ SRX9607666: NTERA-2

◢ SRX1035586: SK-N-SH

◢ SRX1035587: SK-N-SH

◢ SRX1035588: SK-N-SH

◢ SRX1035589: SK-N-SH

◢ SRX4671312: SUM 159PT

◢ SRX4671313: SUM 159PT

◢ SRX4671314: SUM 159PT

◢ SRX19662634: T-47D

◢ SRX19662636: T-47D

◢ SRX682379: TSU-1621MT

◢ SRX014781: UPR9

◢ SRX014782: UPR9

◢ RARA: STRING
LOC102724770 ↻ ≫
DGCR6 ↻ ≫
PSMD1 ↻ ≫
ZNF335 ↻ ≫
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HADHA ↻ ≫
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SERINC5 ↻ ≫
PAK1IP1 ↻ ≫
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ADK ↻ ≫
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HSPA1B ↻ ≫
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ANK2 ↻ ≫
NFKBIL1 ↻ ≫
DDX39B ↻ ≫
ATP6V1G2 ↻ ≫
RBKS ↻ ≫
BABAM2 ↻ ≫
RHBDD3 ↻ ≫
EWSR1 ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
USP1 ↻ ≫
C6orf47 ↻ ≫
APOM ↻ ≫
BAG6 ↻ ≫
PARP11 ↻ ≫
ARHGAP24 ↻ ≫
PPP1R1B ↻ ≫
DMRT3 ↻ ≫
FAM104A ↻ ≫
C17orf80 ↻ ≫
NEUROG2 ↻ ≫
ICMT ↻ ≫
HES3 ↻ ≫
ABCG2 ↻ ≫
ETS1 ↻ ≫
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ICE1 ↻ ≫
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ARHGAP11A ↻ ≫
TLE1 ↻ ≫
FOXP2 ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
LRR1 ↻ ≫
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IPO4 ↻ ≫
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MYLK4 ↻ ≫
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TLE4 ↻ ≫
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NCOR2 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
PTGES2 ↻ ≫
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COMMD1 ↻ ≫
CCT4 ↻ ≫
C5orf63 ↻ ≫
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KBTBD8 ↻ ≫
LHFPL2 ↻ ≫
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UNKL ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
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DCTN3 ↻ ≫
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VEZT ↻ ≫
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FOXD3 ↻ ≫
NEK7 ↻ ≫
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PIPOX ↻ ≫
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CCN1 ↻ ≫
VIP ↻ ≫
PRDM12 ↻ ≫
TMEM107 ↻ ≫
TMEM275 ↻ ≫
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PDHX ↻ ≫
APIP ↻ ≫
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USP17L30 ↻ ≫
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USP17L28 ↻ ≫
USP17L27 ↻ ≫
USP17L26 ↻ ≫
USP17L25 ↻ ≫
USP17L24 ↻ ≫
CITED2 ↻ ≫
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USP17L20 ↻ ≫
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USP17L22 ↻ ≫
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HOXB4 ↻ ≫
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GMPR ↻ ≫
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CRYAA ↻ ≫
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PIGX ↻ ≫
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SEC11C ↻ ≫
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DHRS3 ↻ ≫
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VAV3 ↻ ≫
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GAS7 ↻ ≫
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URM1 ↻ ≫
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JAKMIP1 ↻ ≫
TLE3 ↻ ≫
PPFIBP2 ↻ ≫
PPP1R12B ↻ ≫
CCDC198 ↻ ≫
PKHD1 ↻ ≫
ZGPAT ↻ ≫
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TLE2 ↻ ≫
SKIL ↻ ≫
HMX2 ↻ ≫
BUB3 ↻ ≫
LMO1 ↻ ≫
SPIRE1 ↻ ≫
RARA ↻ ≫
POP5 ↻ ≫
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TMEM72 ↻ ≫
C1orf105 ↻ ≫
NXPH4 ↻ ≫
KLB ↻ ≫
LRGUK ↻ ≫
MTMR7 ↻ ≫
ELAPOR2 ↻ ≫
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UBE2I ↻ ≫
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NEUROG1 ↻ ≫
OSER1 ↻ ≫
PGPEP1L ↻ ≫
CEBPD ↻ ≫
ALKAL2 ↻ ≫
HOXC6 ↻ ≫
SLA ↻ ≫
HOXC5 ↻ ≫
RTL8B ↻ ≫
CDC73 ↻ ≫
ABCB5 ↻ ≫
CHD7 ↻ ≫
OR5A2 ↻ ≫
OR5A1 ↻ ≫
GTF3A ↻ ≫
NUTM2D ↻ ≫
CTNNA3 ↻ ≫
PAM ↻ ≫
DDX3X ↻ ≫
LRRC1 ↻ ≫
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TSPAN13 ↻ ≫
GSX2 ↻ ≫
REV3L ↻ ≫
BICRA ↻ ≫
SNRPN ↻ ≫
MED4 ↻ ≫
RABGAP1L ↻ ≫
MXRA7 ↻ ≫
FLVCR2 ↻ ≫
LRIG1 ↻ ≫
TMEM9 ↻ ≫
FGD3 ↻ ≫
GADD45GIP1 ↻ ≫
STXBP5L ↻ ≫
CAMK2N1 ↻ ≫
GPR61 ↻ ≫
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RASL12 ↻ ≫
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POU2F2 ↻ ≫
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ERCC1 ↻ ≫
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MNX1 ↻ ≫
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PHC2 ↻ ≫
DLG2 ↻ ≫
PRRC2C ↻ ≫
ALPL ↻ ≫
SHF ↻ ≫
NEO1 ↻ ≫
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NINL ↻ ≫
FGFR2 ↻ ≫
CDH16 ↻ ≫
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LECT2 ↻ ≫
CRABP2 ↻ ≫
DMBX1 ↻ ≫
PAH ↻ ≫
ASCL1 ↻ ≫
RILP ↻ ≫
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FOXP1 ↻ ≫
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LOC102724265 ↻ ≫
RGL1 ↻ ≫
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FBXL18 ↻ ≫
ACTB ↻ ≫
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MUSTN1 ↻ ≫
ITIH4 ↻ ≫
TMEM237 ↻ ≫
POTEJ ↻ ≫
ST18 ↻ ≫
HOXC4 ↻ ≫
DMD ↻ ≫
TRPM3 ↻ ≫
TTR ↻ ≫
TRIM65 ↻ ≫
MRPL38 ↻ ≫
PHOX2B ↻ ≫
RUNX1T1 ↻ ≫
BTBD1 ↻ ≫
GJA8 ↻ ≫
CCDC33 ↻ ≫
CPA1 ↻ ≫
ZFX ↻ ≫
SYCP2 ↻ ≫
PPP1R3D ↻ ≫
FAM217B ↻ ≫
PLCH1 ↻ ≫
C1orf226 ↻ ≫
HDAC9 ↻ ≫
FOXN4 ↻ ≫
ST8SIA3 ↻ ≫
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DDO ↻ ≫
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PRSS47 ↻ ≫
PAX8 ↻ ≫
DUSP2 ↻ ≫
ASTL ↻ ≫
KAT6B ↻ ≫
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GALR1 ↻ ≫
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